Abstract 9534: Proteomic Signature of Right Ventricular Failure in Pulmonary Arterial Hypertension
Notice bibliographique
Résumé
Background: Pulmonary arterial hypertension (PAH) is a vascular remodeling disease leading to pulmonary artery pressure elevation and right ventricular (RV) failure. RV failure is the principal determinant of adverse outcomes in PAH patients and represents a major unmet medical need. Thus, a better understanding the pathogenesis of RV failure is mandatory. In this study, we used an unbiased proteomics approach to identify the molecular players engaged in RV failure development caused by PAH. Methods and Results: Proteomics analysis (nano-LC-MS/MS) was performed using control (autopsy, normal RV function, n=10), compensated (cRV, patients with RV hypertrophy and preserved cardiac index>2.2L/min/m 2 , n=10), and decompensated RV (dRV, PAH patients who died from RV failure, n=10). We identified 424 differentially expressed proteins between the dRV and control patients (p<0.05). Of these 424 proteins, 245 were upregulated and 179 were downregulated in the dRV. Using GO enrichment analysis and protein-protein interaction network, we found that upregulated proteins were significantly enriched in pathways involved in immune system and extracellular matrix organization, whereas downregulated proteins were mainly involved in muscle structure development, metabolism, and RNA splicing. To confirm the robustness and sensitivity of the expression changes observed in our proteomic data sets, expression levels of 3 selected proteins implicated in RNA splicing, namely heterogeneous ribonucleoprotein particle (HNRNP)-A1, -C1/C2 and -U, were measured by Western blotting. Consistent with the results of proteomics, these HNRNP proteins were markedly downregulated in dRV compared to cRV or controls (p<0.05). Similar results were observed in RV tissue samples from monocrotaline-injected and pulmonary artery banding-subject rats (n=7-10, p<0.05). In vitro , we demonstrated that knockdown of HNRNPA1 using siRNA prevents phenylephrine-induced cardiomyocyte (H9c2) hypertrophy, as assessed by immunostaining of F-actin and expression of Nppb . Further experiments are currently performed to decipher the role of HNRNPs in RV failure. Conclusions: Our data open novel perspectives for understanding molecular mechanisms of RV failure progression in PAH.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».