Genomic regions associated with resistance to Fusarium wilt in castor identified through linkage and association mapping approaches
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. ricini, is the most destructive disease in castor. Host plant resistance is the best strategy for the management of wilt. Identification of molecular markers linked to wilt resistance will enhance the efficiency and effectiveness of breeding for wilt resistance. In the present study, genomic regions linked to wilt resistance were mapped using a bi-parental population of 185 F6–RILs and a genetically diverse panel of 300 germplasm accessions. Quantitative trait loci (QTL) analysis performed using a linkage map consisting of 1090 SNP markers identified a major QTL on chromosome 7 with an LOD score of 18.7, which explained 44% of the phenotypic variance. The association mapping performed using genotypic data from 3465 SNP loci revealed 69 significant associations (p < 1 × 10−4) for wilt resistance. The phenotypic variance explained by the individual SNPs ranged from 0.063 to 0.210. The QTL detected in the bi-parental mapping population was not identified in the association analysis. Thus, the results of this study indicate the possibility of vast gene diversity for Fusarium wilt resistance in castor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».