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Enregistrement W3217446406 · doi:10.17348/jbrit.v11.i1.1138

Molecular phylogenetic analysis of the north-temperate Labrador Teas (Ericaceae: Rhododendron Subsect. Ledum) suggests a complex genetic history

2017· article· en· W3217446406 sur OpenAlexaboutno aff
Andrew Hart, Kathleen A. Kron, Emily L. Gillespie

Notice bibliographique

RevueJournal of the Botanical Research Institute of Texas · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHong Kong Institute of Education
Mots-clésTaxonEricaceaePhylogenetic treeBiologyChloroplast DNARange (aeronautics)PhylogeneticsMonophylyEvolutionary biologyBotanyClade

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Labrador teas are a group of nearly circumboreal shrubs or sub-shrubs inhabiting damp habitats. The 4–7 currently recognized species are classified within Rhododendron subg. Rhododendron section Rhododendron subsect. Ledum. In floral characters, these species are extremely similar. In vegetative characters, species limits in the Labrador teas have been difficult to determine because many of the traditionally used morphological characters vary continually across the geographic range. This study investigated evolutionary history and preliminary consideration of some species boundaries in the Labrador teas using DNA sequence data from five molecular markers to generate a preliminary phylogeny of R. subsect. Ledum. Data were analyzed using Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian methods. The nuclear data indicate a monophyletic subsect. Ledum, but chloroplast data indicate that the North American taxa have an evolutionary history separate from the European and Asian taxa, suggesting that one or both lineages of subsect. Ledum may be of hybrid origin. Additionally, our analyses suggest that taxa combined in recent treatments (i.e. Rhododendron tomentosum) represent separate lineages and should be recognized as distinct instead of included within more broadly defined species, however our current level of sampling cannot completely resolve this issue. This study lays the groundwork for future phylogenetic studies within subsect. Ledum, illustrating the need to sample more intensively across taxa in order to capture what appears to be a complex genetic and biogeographic history.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,713
Score d'incertitude au seuil0,433

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,108
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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