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Enregistrement W3217462574 · doi:10.1186/s13643-021-01854-8

Comparison of COVID-19 outcomes in organ transplant recipients (OTr) and non-transplant patients: a study protocol for rapid review

2021· article· en· W3217462574 sur OpenAlexaboutno aff
Alexis Hope Lerner, Elizabeth J. Klein, Anna Hardesty, Orestis A. Panagiotou, Chelsea Misquith, Dimitrios Farmakiotis

Notice bibliographique

RevueSystematic Reviews · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesAstellas Pharma
Mots-clésMedicineConfidence intervalMEDLINEObservational studyIntensive care unitMechanical ventilationCohort studyOrgan transplantationIntensive care medicineTransplantationEmergency medicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The COVID-19 pandemic has devastated the global community with nearly 4.9 million deaths as of October 2021. While organ transplant (OT) recipients (OTr) may be at increased risk for severe COVID-19 due to their chronic immunocompromised state, outcomes for OTr with COVID-19 remain disputed in the literature. This review will examine whether OTr with COVID-19 are at higher risk for severe illness and death than non-immunocompromised individuals. METHODS: MEDLINE (via Ovid and PubMed) and EMBASE (via Embase.com ) will be searched from December 2019 to October 2021 for observational studies (including cohort and case-control) that compare COVID-19 clinical outcomes in OTr to those in individuals without history of OT. The primary outcome of interest will be mortality as defined in each study, with possible further analyses of in-hospital mortality, 28 or 30-day mortality, and all-cause mortality versus mortality attributable to COVID-19. The secondary outcome of interest will be the severity of COVID-19 disease, most frequently defined as requiring intensive care unit admission or mechanical ventilation. Two reviewers will independently screen all abstracts and full-text articles. Potential conflicts will be resolved by a third reviewer and potentially discussion among all investigators. Methodological quality will be appraised using the Newcastle-Ottawa Scale. If data permit, we will perform random-effects meta-analysis with the Sidik-Jonkman estimator and the Hartung-Knapp adjustment for confidence intervals to estimate a summary measure of association between histories of transplant with each outcome. Potential sources of heterogeneity will be explored using meta-regression. Additional analyses will be conducted to explore the potential sources of heterogeneity (e.g., subgroup analysis) considering least minimal adjustment for confounders. DISCUSSION: This rapid review will assess the available evidence on whether OTr diagnosed with COVID-19 are at higher risk for severe illness and death compared to non-immunocompromised individuals. Such knowledge is clinically relevant and may impact risk stratification, allocation of organs and healthcare resources, and organ transplantation protocols during this, and future, pandemics. SYSTEMATIC REVIEW REGISTRATION: Open Science Framework (OSF) registration DOI: https://doi.org/10.17605/osf.io/4n9d7 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,058
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,283
Score d'incertitude au seuil0,950

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,058
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,219
Tête enseignante GPT0,541
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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