Abstract 9924: Polygenic Risk Score for PR Interval is Associated with Increased Risk of Ischemic Stroke
Notice bibliographique
Résumé
Atrial cardiomyopathy (AC) is an emerging risk factor for ischemic stroke (IS). We used polygenic risk scores (PRS) to study the association of the PR interval (PRI)-- an ECG marker for AC-- with IS and IS subtypes. We studied PRI, rather than other AC traits, because a validated multi-ethnic PRI-PRS exists. Methods: We calculated PRI-PRS for patients in the NINDS Stroke Genetics Network (SiGN) database, which contains well-characterized stroke patients and in which we have found an association of a PRS for atrial fibrillation with IS subtypes. We derived PRS for 10 GWAS thresholds after a clumping procedure to eliminate SNPs in linkage disequilibrium. SNPs were weighted by their beta coefficients from the GWAS summary statistics to generate PRS. We normalized by the number of SNPs included. We used logistic regression to compare PRI-PRS in stroke cases (n=13930) and non-stroke controls (n=49473). We controlled for sex and the first 10 principal components of genetic ancestry. We stratified by genetic ancestry and genotype platforms. Logistic regression analyses for each stratum were meta-analyzed using an inverse-variance weighting-based method, assuming fixed effects. Results and Conclusions: In the overall meta-analysis, PRI-PRS was weakly associated with increased risk of IS (p<0.02, only for one GWAS threshold). PRI-PRS was associated with increased risk of IS due to small artery occlusion (SAO) (p=0.032 and 0.033, using GWAS of PRI p-value thresholds 0.05 and 0.005 respectively), but not with other IS subtypes. The SAO association may reflect the association of PRI and hypertension, a risk factor for SAO. In a secondary analysis of European strata, we observed a robust association (p<0.02 across all GWAS thresholds) of the PRI-PRS with all IS in GEOS, which consists of younger onset strokes (age of stroke onset < 50 years). PRI-PRS was also associated in GEOS (p<0.01 across all GWAS thresholds) with the subtype of strokes of undetermined origin, which includes embolic strokes of unknown source (ESUS). PRI-PRS was also associated with large artery strokes at some GWAS thresholds in GEOS. Our results suggest that genetic risk for prolonged PRI is associated with SAO and may have more robust associations with other stroke subtypes in some populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,010 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».