Molecular and phenotypic profiling of colorectal cancer patients in West Africa reveals biological insights
Notice bibliographique
Résumé
Understanding the molecular and phenotypic profile of colorectal cancer (CRC) in West Africa is vital to addressing the regions rising burden of disease. Tissue from unselected Nigerian patients was analyzed with a multigene, next-generation sequencing assay. The rate of microsatellite instability is significantly higher among Nigerian CRC patients (28.1%) than patients from The Cancer Genome Atlas (TCGA, 14.2%) and Memorial Sloan Kettering Cancer Center (MSKCC, 8.5%, P < 0.001). In microsatellite-stable cases, tumors from Nigerian patients are less likely to have APC mutations (39.1% vs. 76.0% MSKCC P < 0.001) and WNT pathway alterations (47.8% vs. 81.9% MSKCC, P < 0.001); whereas RAS pathway alteration is more prevalent (76.1% vs. 59.6%, P = 0.03). Nigerian CRC patients are also younger and more likely to present with rectal disease (50.8% vs. 33.7% MSKCC, P < 0.001). The findings suggest a unique biology of CRC in Nigeria, which emphasizes the need for regional data to guide diagnostic and treatment approaches for patients in West Africa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».