Notice bibliographique
Résumé
The <i>Haemophilus, Aggregatibacter, Cardiobacterium, Eikenella, Kingella</i> (HACEK) group genus <i>Eikenella</i> contained a single species, <i>Eikenella corrodens,</i> for many years. In November 2019, <i>Eikenella exigua</i> was described after recovery from a brain abscess and blood culture in Norway. Coincidentally, characterization of 22 Gram-negative bacteria resembling <i>Eikenella</i> from 17 Canadian patients had been underway. Seven isolates from five patients were conclusively identifiable as <i>E. corrodens</i>. One (NML 120819) was deemed to represent a species of the genus <i>Eikenella</i> most closely related to <i>E. corrodens</i>. Fourteen isolates had 97.6 to 98.8% similarities to <i>E. corrodens</i> by 16S rRNA gene sequencing, forming three distinct groups by genome analyses. The largest contained ten anaerobic isolates from eight patients recovered from blood, brain, bone and other abscesses; upon re-evaluation, this group was found to be most consistent with <i>E. exigua</i>. A second facultatively anaerobic clade consisted of two ocular isolates from one patient and a sinus isolate from a second patient. The third taxon consisted of a single strictly anaerobic blood culture isolate. The novel taxa, like <i>E. corrodens</i>, were poorly reactive biochemically and difficult to discern from each other phenotypically and chemotaxonomically, including by cellular fatty acids. MALDI-TOF (Bruker) and whole-genome sequencing were used to further characterize isolates. Draft genomes for the strains had similar DNA G+C contents (55.38-58.53 mol%) while sizes varied from 1.82 Mb to 2.54 Mb. We propose here emendations of the genus <i>Eikenella</i> and the species <i>Eikenella exigua</i>, as well as describing <i>Eikenella halliae</i> sp. nov. NML 130454<sup>T</sup> (=LMG 30894<sup>T</sup>=NCTC 14180<sup>T</sup>) and <i>Eikenella longinqua</i> sp. nov. NML 02-A-017<sup>T</sup> (=LMG 30896<sup>T</sup>=NCTC 14179<sup>T</sup>), on the basis of these findings.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».