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Enregistrement W32666931

Sensitivity of nucleotide excision repair-deficient human cells to ionizing radiation and cyclophosphamide.

2002· article· en· W32666931 sur OpenAlexaff
David Murray, Loretta Vallee-Lucic, Elizabeth Rosenberg, Börje S. Andersson

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXeroderma pigmentosumNucleotide excision repairBiologyMutantComplementationCell cultureMolecular biologyDNA repairCancer researchGeneticsGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nucleotide excision repair (NER)-deficient rodent and human cells (such as those derived from patients with xeroderma pigmentosum, XP) are hypersensitive to UV light. Some of these cell lines, specifically certain rodent mutants with severe defects in the ERCC1 and XPF genes, are dramatically sensitive to crosslinking agents such as phosphoramide mustard (PM). These crosslink-sensitive rodent mutants also exhibit sensitization to gamma-rays under hypoxic (but not under aerated) conditions. Like their rodent counterparts, human XP cells are highly sensitive to UV light; however, none of the human XP lines, even XPF, displays extreme hypersensitivity to crosslinking agents. Studying XP cells, therefore, allows us to further assess the extent to which the phenotypic characteristic of hypoxia-specific radiosensitization of mammalian cells tracks with defects in crosslink repair (as opposed to NER). The sensitivity to PM and gamma-rays of normal human fibroblasts and human XP fibroblasts from two complementation groups, XPA and XPF, was assessed using a clonogenic survival assay. Compared with normal cells, XPA cells were not appreciably hypersensitive to PM or to gamma-rays under either aerated or hypoxic conditions. XPF cells were modestly (approximately 1.75-fold) sensitive to PM but showed no significant radiosensitization under either aerated or hypoxic conditions. Thus, although the phenotype of human XPF cells is quite different from that of "severe" rodent XPF mutants such as UV41, the characteristic of hypoxia-specific radiosensitization consistently tracks with extreme hypersensitivity to crosslinking agents and is separable from UV sensitivity (and thus from defects in NER).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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