Molecular sampling of hop stunt viroid (HSVd) from grapevines in hop production areas in the Czech Republic and hop protection
Notice bibliographique
Résumé
Molecular sampling of HSVd in grapevines in the environs of hop gardens was performed. Specific RT PCR primers were designed to unambiguously distinguish between HLVd and HSVd infections. These primers were used for detection and analysis of HSVd cDNAs from individual samples by thermodynamic methods, TGGE and cDNA heteroduplex analysis. We found that at least 70% of grapevine samples from locations close to hop gardens inNorthern Bohemia(Žatec and Úštěk hop production areas) were infected with HSVd forming populations containing quasispecies. Particular sequence variants, dominant in grapevines from wine-growing areas like Znojmo, were also found in minor private vineyards. HSVd was experimentally transmissible (80% success) from these samples to Osvald's clone 72 of Czech hop, where according to the cDNA library screening, one of the dominant HSVdg variants corresponding to AC E01844 was detected in early populations three weeks p.i. HSVd was detected neither in reproduction materials nor in examined hop gardens. However a potential danger for hop cultivation, consisting in the high biological potential of HSVd spread is discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».