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Enregistrement W337059603 · doi:10.1155/2009/962617

Prevalence and Characterization of Extended‐Spectrum Beta‐Lactamase‐Producing Enterobacteriaceae Isolated in Canadian Hospitals: Results from CANWARD 2007

2009· article· en· W337059603 sur OpenAlexaffabout
Patricia J. Baudry, Melissa McCracken, Philippe Lagacé‐Wiens, Michael R. Mulvey, George G. Zhanel, Daryl J. Hoban

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of ManitobaHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesWyethBayer
Mots-clésKlebsiella pneumoniaeBroth microdilutionMicrobiologyBeta-lactamaseGentamicinEnterobacteriaceaeGenotypeMultilocus sequence typingBiologyMolecular epidemiologySulfamethoxazoleEscherichia coliMultiple drug resistanceDrug resistanceAntibioticsMinimum inhibitory concentrationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: The purpose of the present study was to determine the prevalence and molecular epidemiology of extended‐spectrum beta‐lactamase (ESBL)‐producing Enterobacteriaceae identified from Canadian hospitals in 2007. METHODS: Clinically significant isolates were collected as part of the Canadian Ward Surveillance Study (CANWARD 2007) from January to December 2007, inclusive, from 12 sentinel hospital centres across Canada. Minimum inhibitory concentrations were determined by broth microdilution, and putative ESBL isolates were confirmed by the Clinical and Laboratory Standards Institute disk diffusion method. Polymerase chain reaction and DNA sequencing were used to detect blaSHV, blaTEM, blaCTX-M and blaOXA-like genes. Strains were typed using pulsed‐field gel electrophoresis. RESULTS: A total of 3.4% and 1.6% of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, respectively, were identified as ESBL producers. Resistance to fluoroquinolones, doxycycline, trimethoprim/sulfamethoxazole and gentamicin occurred in 92.5% and 71.4%, 75.5% and 71.4%, 67.9% and 57.1%, and 58.5% and 57.1% of ESBL‐producing E coli and K pneumoniae, respectively. A total of 90.6% and 71.4% of ESBL‐producing E coli and K pneumoniae were identified as multidrug resistant. The CTX‐M type was the predominant ESBL, with CTX‐M‐15 as the predominant genotype. A total of 81.7% ESBL‐producers carried several beta‐lactamase genes. Pulsed‐field gel electrophoresis revealed that the majority of ESBL producers were not genetically related (less than 80% homology). Similar patient demographics were observed among both ESBL‐producing E coli and K pneumoniae. CONCLUSION: CTX‐M has become the most common enzyme among both ESBL‐producing E coli and K pneumoniae. The spread of ESBLproducing bacteria across Canada is polyclonal and is not due to the clonal spread of a single strain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,139

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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