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Enregistrement W33824212 · doi:10.1128/mbio.00130-21

Informe sobre el estudio de muestras de cerámica de El cordón litoral de La Graciosa (Lanzarote)

2009· article· en· W33824212 sur OpenAlexfundno aff
María José Feliu Ortega, María del Carmen Edreira Sánchez

Notice bibliographique

RevuemBio · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineArts and Humanities
ThématiqueArchaeological and Historical Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Carbohydrate recognition by lectins governs critical host-microbe interactions. <i>Mp</i>PA14 (<i>Marinomonas primoryensis</i> PA14 domain) lectin is a domain of a 1.5-MDa adhesin responsible for a symbiotic bacterium-diatom interaction in Antarctica. Here, we show that <i>Mp</i>PA14 binds various monosaccharides, with l-fucose and <i>N</i>-acetylglucosamine being the strongest ligands (dissociation constant [<i>K<sub>d</sub></i> ], ∼150 μM). High-resolution structures of <i>Mp</i>PA14 with 15 different sugars bound elucidated the molecular basis for the lectin's apparent binding promiscuity but underlying selectivity. <i>Mp</i>PA14 mediates strong Ca<sup>2+</sup>-dependent interactions with the 3,4-diols of l-fucopyranose and glucopyranoses, and it binds other sugars via their specific minor isomers. Thus, <i>Mp</i>PA14 only binds polysaccharides like branched glucans and fucoidans with these free end groups. Consistent with our findings, adhesion of <i>Mp</i>PA14 to diatom cells was selectively blocked by l-fucose, but not by <i>N</i>-acetyl galactosamine. The <i>Mp</i>PA14 lectin homolog present in a <i>Vibrio cholerae</i> adhesin was produced and was shown to have the same sugar binding preferences as <i>Mp</i>PA14. The pathogen's lectin was unable to effectively bind the diatom in the presence of fucose, thus demonstrating the antiadhesion strategy of blocking infection via ligand-based antagonists.<b>IMPORTANCE</b> Bacterial adhesins are key virulence factors that are essential for the pathogen-host interaction and biofilm formation that cause most infections. Many of the adhesin-driven cell-cell interactions are mediated by lectins. Our study reveals for the first time the molecular basis underlying the binding selectivity of a common bacterial adhesin lectin from the marine bacterium <i>Marinomonas primoryensis</i>, homologs of which are found in both environmental and pathogenic species. The lectin-ligand interactions illustrated at the atomic level guided the identification of a ligand that serves as an inhibitor to block bacterium-host adhesion. With conventional bactericidal antibiotics losing their potency due to resistance, our work gives critical insight into an antiadhesion strategy to treat bacterial infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,742
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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