Crystal structure of a tandemly repeated PTP‐like <i>myo</i> ‐inositol hexa <i>kis</i> phosphatase (phytase)
Notice bibliographique
Résumé
Inositol phosphatases are involved in a variety of eukaryotic and prokaryotic cellular functions. Phytases are a phosphatase class that preferentially hydrolyze myo ‐inositol hexa kis phosphate (InsP 6 ) to lower phosphorylated myo ‐inositols. InsP 6 is the most abundant inositol phosphate in the cell and has been implicated in important cellular processes including DNA repair, mRNA export, cellular signaling, endocytosis and vesicular trafficking. The phytase expressed by Mitsuokella multacida (PhyAmm) is composed of tandemly repeated domains each possessing a protein tyrosine phosphatase active site signature sequence. Mutation of the N‐terminal catalytic cysteine (C250) to serine has no effect on the catalytic activity of the protein, whereas mutation of the equivalent residue in the C‐terminal domain (C548) completely inactivates the enzyme. These results indicate that despite the presence of all the catalytic residues, the N‐terminal domain of PhyAmm is inactive against InsP 6 . The crystal structure of PhyAmm was solved to further examine the role of the inactive domain. A comparison of the active and inactive domains has identified differences that may explain why the N‐terminal domain lacks catalytic activity, and suggests this domain may be capable of hydrolyzing lower phosphorylated myo ‐inositols. This work is supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada and the Alberta Ingenuity Fund.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».