Population Size Does Not Predict Artifact Complexity: Analysis of Data from Tasmania, Arctic Hunter-Gatherers, and Oceania Fishing Groups
Notice bibliographique
Résumé
VhCBP is a periplasmic chitooligosaccharide-binding protein mainly responsible for translocation of the chitooligosaccharide (GlcNAc)<sub>2</sub> across the double membranes of marine bacteria. However, structural and thermodynamic understanding of the sugar-binding/-release processes of VhCBP is relatively less. VhCBP displayed the greatest affinity toward (GlcNAc)<sub>2</sub>, with lower affinity for longer-chain chitooligosaccharides [(GlcNAc)<sub>3-4</sub>]. (GlcNAc)<sub>4</sub> partially occupied the closed sugar-binding groove, with two reducing-end GlcNAc units extending beyond the sugar-binding groove and barely characterized by weak electron density. Mutation of three conserved residues (Trp<sup>363</sup>, Asp<sup>365</sup>, and Trp<sup>513</sup>) to Ala resulted in drastic decreases in the binding affinity toward the preferred substrate (GlcNAc)<sub>2</sub>, indicating their significant contributions to sugar binding. The structure of the W513A-(GlcNAc)<sub>2</sub> complex in a 'half-open' conformation unveiled the intermediary step of the (GlcNAc)<sub>2</sub> translocation from the soluble CBP in the periplasm to the inner membrane-transporting components. Isothermal calorimetry data suggested that VhCBP adopts the high-affinity conformation to bind (GlcNAc)<sub>2</sub>, while its low-affinity conformation facilitated sugar release. Thus, chitooligosaccharide translocation, conferred by periplasmic VhCBP, is a crucial step in the chitin catabolic pathway, allowing Vibrio bacteria to thrive in oceans where chitin is their major source of nutrients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,008 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».