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Enregistrement W34770226 · doi:10.3390/ijerph182111712

Studies in the expression and modulation of mucosal addressin cell adhesion molecule-1 (MAdCAM-1)

2011· dissertation· en· W34770226 sur OpenAlexfundno aff
Aftab Ala

Notice bibliographique

RevueDoctoral thesis, UCL (University College London). · 2011
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSocial Sciences and Humanities Research Council
Mots-clésAddressinCell adhesion moleculeLamina propriaBiologyLymphocyte homing receptorCell adhesionImmunologyPathologyCellMedicineEpithelium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The endothelial mucosal cell adhesion molecule (MAdCAM-1) is \nconsidered to be critically important in recruiting lymphocytes expressing the α4β7 cell \nsurface integrin. In addition to its well-characterised role in the normal gastrointestinal \ntract, there is emerging evidence of its role in liver and gastrointestinal inflammation. The \nability to detect MAdCAM-1 has thus far been challenging, hindering progress into studies \nto explore its modulation. \nAims: (i) To characterise MAdCAM-1 in the liver and gut, (ii) establish an in vitro \nmodel system of MAdCAM-1 and (iii) investigate the factors leading to its expression \nand subsequent modulation. \nMethods: I have described novel methods of detecting MAdCAM-1 by: \n1. Characterising its presence in the human liver, gut and associated tissues e.g. pancreas. \n2. Developing a reverse transcriptase–polymerase chain reaction (RT-PCR) technique so as \nto detect MAdCAM-1 in the gastrointestinal system and thus quantify its expression using \nReal-Time RT-PCR analysis. \n3. Developing an in vitro cell culture system using the endothelial SVEC4-10 cells to express \nand subsequently modulate the expression of MAdCAM-1. \nResults: Using immunohistochemical methodology I found that in end stage chronic liver \ndisease, MAdCAM-1 is expressed primarily on the peribiliary plexus and lymphoid \naggregates, where it may facilitate lymphocyte egress. MAdCAM-1’s constitutive \nexpression was confirmed in histologically normal gut tissue and its upregulation was \ndemonstrated in ulcerative colitis and Crohn’s disease, particularly localised to the venular \nendothelium of the lamina propria and follicular dendritic cells. MAdCAM-1 mRNA from \nhuman gut was measured by a RT-PCR technique in which a 94 base pair product \nconsistent with human mucosal vascular MAdCAM-1 was detected in normal large bowel. \nReal Time analysis confirmed that MAdCAM-1 was upregulated in end stage liver \ndisease. In a cell culture system MAdCAM-1 was shown to be upregulated by TNFα on \nSVEC4-10 using immunofluoresence studies and its expression was further modulated by \nsteroids and anti-sense oligonucleotides. \nConclusion: The importance of MAdCAM-1 in the gastrointestinal system is emphasised \nthroughout. Our in vitro culture system utilising the SVEC endothelial cell line provides \nthe basis for studying the modulation of MAdCAM-1 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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