An exon trap with proper poly-A site in the GBE1 is the common missing cause in Adult Polyglucosan Body Disease (S42.006)
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Identify the underlying genetic cause of glycogen branching enzyme (GBE) deficiency in manifesting heterozygous patients of adult polyglucosan body disease (APBD). BACKGROUND: APBD is an autosomal recessive leukodystrophy caused by mutations in glycogen branching enzyme (GBE1). It is a late onset variant of glycogen storage disorder type-IV. Most patients are Ashkenazi-Jewish descendants, 70[percnt] of whom have homozygous GBE1 mutations. The remaining 30[percnt] are heterozygous for the p.Y329S mutation. The second mutation was not found until now in those patients in spite of whole-genome sequencing. This had raised the possibility that p.Y329S heterozygous cases were somehow ‘manifesting heterozygotes’. DESIGN/METHODS: We studied 16 APBD patients who are heterozygous for p.Y329S mutation in GBE1 with yet have unlikely low GBE activity with no other known mutation in 16 exons. RESULTS: GBE1 mRNA has been reverse transcribed and sequenced, all manifesting heterozygous patients were homozygous for c.986A>C mutation substituting tyrosine with serine. The mRNA transcript from the other allele was missing the exon 16 and 3’UTR. GBE encoded by this copy was degraded in the cell causing the further decrease of enzyme activity from 18[percnt] to 8[percnt]. Sequencing of polyA tailed mRNA revealed an exon splice site that changes last exon and 3’UTR. CONCLUSIONS: We now identified this deep-intronic mutation, which acts as a gene-trap, creating an ectopic last-exon, 3’UTR and degraded protein. This second-most common APBD mutation now explains all Ashkenazi-Jewish cases and a molecular mechanism for manifesting heterozygosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».