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Enregistrement W37370287 · doi:10.3390/antibiotics12060967

Bardet-Biedl syndrome in Newfoundland : molecular genetics of a rare recessive disorder in a small isolated population

2001· dissertation· en· W37370287 sur OpenAlexaboutno aff
Michael O. Woods

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesStichting Zeldzame Ziekten FondsEuropean Commission
Mots-clésBardet–Biedl syndromeGeneticsBiologyPopulationPolydactylyLocus (genetics)HaplotypeConsanguinityFrameshift mutationGenePhenotypeAlleleMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bardet-Biedl syndrome (BBS) is characterized by retinal dystrophy, dysmorphicextremities, renal structural abnormalities, obesity, and hypogenitalism in males. This autosomal recessive disorder is genetically heterogenous with four identified loci, BBS1-4 (11q, 16q, 3p and 15q respectively). BBS is a relatively rare disorder, but it is approximately ten times more prevalent in Newfoundland than in northern European populations. -- To investigate the high incidence of BBS in the Newfoundland population, members of 17 BBS families were analyzed by haplotype and linkage analyses. Initially, linkage of five families to BBS1 one each to BBS2 and BBS3 and exclusion of six families from the four known BBS loci was observed. -- A large consanguineous Newfoundland BBS family, excluded from the four known BBS loci, was used to identify a fifth BBS gene locus (BBS5) on 2q31 in a genome-wide scan. However, this gene did not segregate in any other of the five unlinked families. Therefore, another genome scan was implemented on a consanguineous family excluded from the five BBS loci. Evidence of a sixth BBS gene (BBS6) on 20p12 was established and the critical interval narrowed to 2 cM using five other unlinked families. Located within this region is a putative chaperonin gene (MKKS) involved in McKusick-Kaufman syndrome, a disorder with an overlapping phenotype with BBS. When MKKS was screened for mutations in six Newfoundland BBS families, one missense and two frameshift mutations were identified. Thus, MKKS was the first gene identified to cause BBS. Remarkably, one family could be excluded from all six BBS loci, indicating the existence of a seventh BBS gene (BBS7). -- By mutational and/or haplotype and linkage analyses, it was possible to assign 14 of the 17 Newfoundland BBS families to known BBS loci. Six families had mutations in MKKS/BBS6, five families were associated with the BBS1 locus, and one family to each of the BBS2, BBS3 and BBS5 loci. Additionally, one family was excluded from the six known BBS loci. The discovery of MKKS/BBS6 should aid in the ascertainment of other BBS genes and contribute to the basic understanding of the manifestations of BBS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,409
Score d'incertitude au seuil0,822

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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