Approaches to the discovery of biomarkers of prostate carcinogenesis in TRAMP mice and of chemopreventive efficacy of tea polyphenols
Notice bibliographique
Résumé
To improve prostate cancer management in humans who have, or are at risk of\ndeveloping, the disease, biomarkers are required to aid early diagnosis and\nmonitoring of response to chemotherapeutic or chemopreventive intervention.\nIn this project metabonomic and peptidomic approaches were used to study\nbiological changes associated with prostate carcinogenesis in a transgenic mouse\nmodel (TRAMP, TRansgenic Adenocarcinoma of the Mouse Prostate). Observed\nchanges were compared with pathological alterations. Metabolome and peptidome\nanalyses were conducted in TRAMP mice exposed to chemopreventive intervention\nwith green tea polyphenols (GTP). Effects of consumption of GTP or black tea\ntheaflavins on the plasma and urine metabonome/peptidome in patients with benign\nprostatic hyperplasia (BPH) were also investigated. Oxidative stress status reflected\nby urinary 8-oxo-7,8-dihydro-2’-deoxyguanosine (8-oxodG) was assessed in mice\nand humans on tea polyphenols.\nMetabonomic profiling revealed that at early stages of carcinogenesis in mice,\nalterations of tumour levels of choline metabolites resembled the human disease. In\ncontrast, in advanced stages of TRAMP prostate carcinogenesis, phospholipid\nmetabolism is affected differently by malignancy than in its human counterpart.\nDisturbed prostate-specific citrate metabolism seems common to both human and\nTRAMP prostate tumours when compared to normal tissue. These results suggest\nthat the TRAMP mouse may be a better model with respect to humans of early stage\ncarcinogenesis with minor proliferative lesions than of more advanced stages of\nmalignancy.\nUrinary 8-oxodG levels were not affected by presence of prostate cancer or\nintervention with tea. Metabolic profiling gave evidence for an effect of GTP on\nenergy metabolism in both mice and humans. Although TRAMP and GTP-groupspecific\nmetabonomic and peptidomic changes were found in plasma and urine, none\nof these metabolites or peptides could be unambiguously identified as biomarkers of\ncarcinogenesis or GTP exposure. Among possible confounding factors which should\nbe taken into consideration in future metabonomic/peptidomic studies is the host’s\ngut microflora.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».