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Enregistrement W4200004786 · doi:10.1016/j.cbd.2021.100950

Expression of immune markers of white sturgeon (Acipenser transmontanus) during Veronaea botryosa infection at different temperatures

2021· article· en· W4200004786 sur OpenAlexafffund
Esteban Soto, Mark D. Fast, Sara L. Purcell, Denver Coleman, Zeinab Yazdi, Kirsten Kenelty, Susan Yun, Alvin C. Camus

Notice bibliographique

RevueComparative Biochemistry and Physiology Part D Genomics and Proteomics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureOcean Frontier Institute
Mots-clésBiologySturgeonHaptoglobinImmune systemAcute-phase proteinAcipenserGillImmunologyAndrologyPhysiologyInternal medicineEndocrinologyInflammationFish <Actinopterygii>Fishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Systemic phaeohyphomycosis caused by Veronaea botryosa is one of the most important emergent diseases to affect sturgeon aquaculture in North America. White sturgeon (Acipenser transmontanus) cultured at temperatures above 15 °C are at higher risk of severe disseminated disease and higher mortalities. Despite this, little is known regarding disease pathogenesis and the immune response to infection. The objective of this study was to investigate the acute (2 days post-challenge [dpc]) and chronic (32 dpc) response of white sturgeon at 13 °C and 18 °C challenged with V. botryosa via intramuscular injection, using gene expression analysis of a diverse array of soluble immune and inflammatory mediators. Significantly greater amounts of irf8 (p < 0.05) and tfg-β (p < 0.05) genes were detected in gills of exposed fish at 18 °C when compared to those at 13 °C 32 dpc. Transcript levels of haptoglobin, serotransferrin, serum amyloid, cathelicidin, tnf-α, and il-17 were significantly increased in splenic tissues of challenged fish maintained at 18 °C late in infection (p < 0.05). However, only haptoglobin and serotransferrin transcript abundance were significantly greater in exposed fish when compared to controls 32dpc. Moreover, haptoglobin transcripts at this time point were significantly greater in exposed fish at 18 °C when compared to those challenged at 13 °C. Fewer differences were detected in fish kept at 13 °C. In agreement with transcript quantification, western blot assessment of haptoglobin showed increased levels in the challenged fish maintained at 18 °C.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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