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Enregistrement W4200013486 · doi:10.1186/s13068-021-02096-5

Cocktail biosynthesis of triacylglycerol by rational modulation of diacylglycerol acyltransferases in industrial oleaginous Aurantiochytrium

2021· article· en· W4200013486 sur OpenAlexaff
Chuanzeng Lan, Sen Wang, Huidan Zhang, Zhuojun Wang, Weijian Wan, Huan Liu, Yang Hu, Qiu Cui, Xiaojin Song

Notice bibliographique

RevueBiotechnology for Biofuels · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaYoung Scientists FundCollaborative Innovation Center of Major Machine Manufacturing in LiaoningNatural Science Foundation of Shandong ProvinceChinese Academy of SciencesDalian National Laboratory for Clean EnergyNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPolyunsaturated fatty acidDiacylglycerol kinaseAcyltransferasesBiochemistryFatty acidDegree of unsaturationEnzymeYeastBiosynthesisChemistryFood scienceBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Triacylglycerol (TAG) is an important storage lipid in organisms, depending on the degree of unsaturation of fatty acid molecules attached to glycerol; it is usually used as the feedstock for nutrition or biodiesel. However, the mechanism of assembly of saturated fatty acids (SFAs) or polyunsaturated fatty acids (PUFAs) into TAGs remains unclear for industrial oleaginous microorganism. RESULTS: Diacylglycerol acyltransferase (DGAT) is a key enzyme for TAG synthesis. Hence, ex vivo (in yeast), and in vivo functions of four DGAT2s (DGAT2A, DGAT2B, DGAT2C, and DGAT2D) in industrial oleaginous thraustochytrid Aurantiochytrium sp. SD116 were analyzed. Results revealed that DGAT2C was mainly responsible for connecting PUFA to the sn-3 position of TAG molecules. However, DGAT2A and DGAT2D target SFA and/or MUFA. CONCLUSIONS: There are two specific TAG assembly routes in Aurantiochytrium. The "saturated fatty acid (SFA) TAG lane" primarily produces SFA-TAGs mainly mediated by DGAT2D whose function is complemented by DGAT2A. And, the "polyunsaturated fatty acid (PUFA) TAG lane" primarily produces PUFA-TAGs via DGAT2C. In this study, we demonstrated the functional distribution pattern of four DGAT2s in oleaginous thraustochytrid Aurantiochytrium, and provided a promising target to rationally design TAG molecular with the desired characteristics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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