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Enregistrement W4200029573 · doi:10.1016/j.jcf.2021.12.012

Antisense oligonucleotide splicing modulation as a novel Cystic Fibrosis therapeutic approach for the W1282X nonsense mutation

2021· article· en· W4200029573 sur OpenAlexaff
Yifat S. Oren, O. Avizur-Barchad, E. Ozeri-Galai, R. Elgrabli, Meital R. Schirelman, Tehilla Blinder, Chava D. Stampfer, Merav Ordan, Onofrio Laselva, Malena Cohen‐Cymberknoh, Eitan Kerem, Christine E. Bear, Batsheva Kerem

Notice bibliographique

RevueJournal of Cystic Fibrosis · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIvacaftorExonNonsense mutationExon skippingMedicineCystic fibrosisMutationRNA splicingAlternative splicingCell biologyCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorBiologyGeneGeneticsRNAInternal medicineMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Antisense oligonucleotide- based drugs for splicing modulation were recently approved for various genetic diseases with unmet need. Here we aimed to generate skipping over exon 23 of the CFTR transcript, to eliminate the W1282X nonsense mutation and avoid RNA degradation induced by the nonsense mediated mRNA decay mechanism, allowing production of partially active CFTR proteins lacking exon 23. METHODS: ∼80 ASOs were screened in 16HBEge W1282X cells. ASO candidates showing significant exon skipping were assessed for their W1282X allele selectivity and the increase of CFTR protein maturation and function. The effect of a highly potent ASO candidates was further analyzed in well differentiated primary human nasal epithelial cells, derived from a W1282X homozygous patient. RESULTS: ASO screening led to identification of several ASOs that significantly decrease the level of CFTR transcripts including exon 23. These ASOs resulted in significant levels of mature CFTR protein and together with modulators restore the channel function following free uptake into these cells. Importantly, a highly potent lead ASOs, efficiently delivered by free uptake, was able to increase the level of transcripts lacking exon 23 and restore the CFTR function in cells from a W1282X homozygote patient. CONCLUSION: The highly efficient exon 23 skipping induced by free uptake of the lead ASO and the resulting levels of mature CFTR protein exhibiting channel function in the presence of modulators, demonstrate the ASO therapeutic potential benefit for CF patients carrying the W1282X mutation with the objective to advance the lead candidate SPL23-2 to proof-of-concept clinical study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,769
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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