Submergence of the filamentous Zygnematophyceae Mougeotia induces differential gene expression patterns associated with core metabolism and photosynthesis
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Notice bibliographique
Résumé
The streptophyte algal class Zygnematophyceae is the closest algal sister lineage to land plants. In nature, Zygnematophyceae can grow in both terrestrial and freshwater habitats and how they do this is an important unanswered question. Here, we studied what happens to the zygnematophyceaen alga Mougeotia sp., which usually occurs in permanent and temporary freshwater bodies, when it is shifted to liquid growth conditions after growth on a solid substrate. Using global differential gene expression profiling, we identified changes in the core metabolism of the organism interlinked with photosynthesis; the latter went hand in hand with measurable impact on the photophysiology as assessed via pulse amplitude modulation (PAM) fluorometry. Our data reveal a pronounced change in the overall physiology of the alga after submergence and pinpoint candidate genes that play a role. These results provide insight into the importance of photophysiological readjustment when filamentous Zygnematophyceae transition between terrestrial and aquatic habitats.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle