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Enregistrement W4200039271 · doi:10.1001/jamanetworkopen.2021.41089

Incidence and Outcomes Associated With <i>Clostridioides difficile</i> Infection in Solid Organ Transplant Recipients

2021· article· en· W4200039271 sur OpenAlexafffundabout
Seyed M. Hosseini‐Moghaddam, Bin Luo, Sarah E. Bota, Shahid Husain, Michael Silverman, Nick Daneman, Kevin A. Brown, J. Michael Paterson

Notice bibliographique

RevueJAMA Network Open · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensMcMaster UniversitySunnybrook Health Science CentreWestern UniversityPublic Health OntarioUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesSchulich School of Medicine and DentistrySchulich School of Medicine and Dentistry, Western UniversityOntario Ministry of Health and Long-Term CareAcademic Medical Organization of Southwestern OntarioLawson Health Research Institute
Mots-clésMedicineIntensive care unitIncidence (geometry)DialysisInternal medicineToxic megacolonAcute kidney injuryPopulationCohortPediatricsDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: Little is known about the incidence and outcomes of Clostridioides difficile infection (CDI) in solid organ transplant (SOT) recipients. Objective: To estimate the CDI incidence and outcomes in SOT recipients. Design, Setting, and Participants: A population-based cohort study was conducted using administrative health care data for all Ontario, Canada, residents who received organ allografts from April 1, 2003, to December 31, 2017; March 31, 2020, was the end of the study period. Main Outcomes and Measures: The primary outcome was hospital admission with CDI diagnosis. The secondary outcomes included all-cause death, intensive care unit admission, acute kidney injury requiring dialysis, and fulminant CDI comprising any of the following: toxic megacolon, ileus, perforation, or colectomy. The association between short- vs long-term mortality (ie, death occurring within or after 90 days post-CDI) and the following variables was evaluated: age, sex, Deyo-Charlson Comorbidity Index, SOT type, early- vs late-onset CDI, fulminant CDI, intensive care unit admission, and acute kidney injury requiring acute dialysis. Results: Overall, 10 724 SOT recipients (6901 [64.4%] men; median age, 54 [IQR, 44-62] years) were eligible. Kidney transplant was the most common SOT type (6453 [60.2%]). The median follow-up time was 5.0 (IQR, 2.3-8.8) years, resulting in 61 987 person-years of follow-up. A total of 726 patients (6.8%) were hospitalized with CDI. The 1-year CDI incidence significantly increased in annual cohorts (ie, from 23.1; 95% CI, 12.8-41.8 per 1000 person-years in 2004 to 46.7; 95% CI, 35.0-62.3 per 1000 person-years in 2017; P = .001). Clostridioides difficile was associated with a 16.8% rate (n = 122) of 90-day mortality. In patients who underwent kidney transplant, CDI was typically late-onset (median interval, 2.2; IQR, 0.4-6.0 years) compared with recipients of other organs. Acute kidney injury requiring dialysis was significantly associated with short-term (adjusted odds ratio [aOR], 1.86; 95% CI, 1.07-3.26) and long-term (adjusted hazard ratio [aHR], 1.89; 95% CI, 1.29-2.78) mortality, and late-onset CDI was also significantly associated with a greater risk of short-term (aOR, 4.26; 95% CI, 2.51-7.22) and long-term (aHR, 2.49; 95% CI, 1.78-3.49) mortality. Conclusions and Relevance: In this study, increasing CDI trends in annual cohorts of SOT recipients were observed. Posttransplant CDI was associated with mortality, and late-onset CDI was associated with a greater risk of death than early-onset CDI. These findings suggest that preventive strategies should not be limited to the initial months following transplantation. Comprehensive therapeutic approaches targeting acute kidney injury risk factors in SOT recipients may reduce short- and long-term post-CDI mortality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnellow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnelhigh
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,934

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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