MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4200043562 · doi:10.1101/2021.11.11.468158

Steroid-resistant nephrotic syndrome associated <i>MYO1E</i> mutations have differential effects on myosin 1e localization, dynamics, and activity

2021· preprint· en· W4200043562 sur OpenAlexaff
Pei‐Ju Liu, Laura K. Gunther, Diana Perez, Jing Bi‐Karchin, Christopher D. Pellenz, Sharon E. Chase, Maria F. Presti, Éric Plante, Claire E. Martin, Svjetlana Lovric, Christopher M. Yengo, Friedhelm Hildebrandt, Mira Krendel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensSinai Health SystemUniversity of GuelphLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantBiologyCell biologyMutationPodocyteEndocytosisMyosinMolecular biologyCellGeneGeneticsKidney

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Myo1e is a non-muscle motor protein enriched in the podocyte foot processes. Mutations in MYO1E are associated with steroid-resistant nephrotic syndrome (SRNS). Here, we set out to differentiate between the pathogenic and neutral MYO1E variants identified in SRNS patients by exome sequencing. Based on protein sequence conservation and structural predictions, two mutations in the motor domain, T119I and D388H, were selected for this study. EGFP-tagged Myo1e constructs were delivered into the Myo1e-KO podocytes via adenoviral infection to analyze Myo1e protein stability, Myo1e localization, and clathrin-dependent endocytosis, which is known to involve Myo1e activity. Furthermore, truncated Myo1e constructs were expressed using the baculoviral expression system and used to measure Myo1e ATPase and motor activity in vitro . Both mutants were expressed as full-length proteins in the Myo1e-KO podocytes. However, unlike wild-type (WT) Myo1e, the T119I variant was not enriched at the cell junctions or clathrin-coated vesicles (CCVs) in podocytes. In contrast, the D388H variant localization was similar to the WT. Surprisingly, the dissociation of the D388H variant from cell-cell junctions and CCVs was decreased, suggesting that this mutation also affects Myo1e activity. The ATPase activity and the ability to translocate actin filaments were drastically reduced for the D388H mutant, supporting the findings from cell-based experiments. The experimental pipeline developed in this study allowed us to determine that the T119I and D388H mutations appear to be pathogenic and gain additional knowledge in the Myo1e role in podocytes. This workflow can be applied to the future characterization of novel MYO1E variants associated with SRNS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetRenal Diseases and Glomerulopathies→Travaux en français237 207→