The devil is in the details: emerging insights on the relevance of wastewater surveillance for SARS-CoV-2 to public health
Notice bibliographique
Résumé
The severe health consequences and global spread of the COVID-19 pandemic have necessitated the rapid development of surveillance programs to inform public health responses. Efforts to support surveillance capacity have included an unprecedented global research response into the use of genetic signals of SARS-CoV-2 in wastewater following the initial demonstration of the virus' detectability in wastewater in early 2020. The confirmation of fecal shedding of SARS-CoV-2 from asymptomatic, infected and recovering individuals further supports the potential for wastewater analysis to augment public health conventional surveillance techniques based on clinical testing of symptomatic individuals. We have reviewed possible capabilities projected for wastewater surveillance to support pandemic management, including independent, objective and cost-effective data generation that complements and addresses attendant limitations of clinical surveillance, early detection (i.e., prior to clinical reporting) of infection, estimation of disease prevalence, tracking of trends as possible indicators of success or failure of public health measures (mask mandates, lockdowns, vaccination, etc.), informing and engaging the public about pandemic trends, an application within sewer networks to identify infection hotspots, monitoring for presence or changes in infections from institutions (e.g., long-term care facilities, prisons, educational institutions and vulnerable industrial plants) and tracking of appearance/progression of viral variants of concern.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,007 | 0,008 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,006 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».