Early mRNA Expression of Neuroendocrine Differentiation Signals Predicts Recurrence After Radical Prostatectomy: A Transcriptomic Analysis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Neuroendocrine differentiation (NED) of prostate cancer (PC) is a process that often occurs under evolutionary pressure from pharmacologic blockade of androgen receptor signaling at advanced stages of the disease. Identifying a subset of early PC that has a higher likelihood to evolve into this entity is key for developing therapeutic strategies that could more effectively target this phenotype. This study aimed to assess the prognostic relevance of mRNA expression of major players involved in NED of primary prostate tumors. METHODS: RNA sequencing data from 122 patients with localized PC were analyzed. Transcript levels of key genes involved in NED, with a focus on endothelin axis and nuclear factor kappa B (NF-κB), were assessed and were correlated with time to prostate specific antigen (PSA) recurrence. Copy number alteration of tumor suppressor genes and gene expression of additional signals hallmarking NED was compared between altered and unaltered groups, including lineage determining transcription factors, transcriptional repressors, cell cycle and epigenetic regulators. RESULTS: The presence of altered mRNA expression using a z-score threshold of 2 in NFKB1, RELA, EDN1, EDNRA, and EDNRB genes was associated with a higher Gleason score (P < 0.001) and a shorter time to biochemical recurrence (BCR) (P = 0.029). There was a significant direct correlation between NFKB1 and RELA (P < 0.001), NFKB1 and EDNRA (P < 0.001), NFKB1 and EDNRB (P < 0.001), EDNRA and EDNRB expression (P < 0.001). ASCL1 (q < 0.001), ONECUT2 (q < 0.001), DLL3 (q = 0.019), AURKA (q = 0.013), AURKB (q = 0.014), PLK1 (q < 0.001), and EZH2 (q < 0.001) were enriched in patients with tumors harboring alterations in endothelin axis and NF-κB subunit genes whereas REST was downregulated (q < 0.001). CONCLUSIONS: This analysis suggests that altered mRNA expression of NF-κB and endothelin axis genes in early PC is not only a harbinger of a more aggressive clinical course but is also associated with aberrant gene expression of several transcription factors, transcriptional repressors, cell cycle and epigenetic regulators that are directly involved in NED, in line with their biological roles. This may have implications for closer follow-up and potential use of targeted therapeutic approaches postoperatively in the adjuvant setting to improve outcomes of these patients.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».