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Enregistrement W4200079077 · doi:10.1002/eji.202170126

Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies (third edition)

2021· review· en· W4200079077 sur OpenAlexaff
Andrea Cossarizza, Hyun‐Dong Chang, Andreas Radbruch, Sergio Abrignani, Richard Addo, Mübeccel Akdiş, Immanuel Andrä, Francesco Andreata, Francesco Annunziato, Eduardo Arranz, Petra Bächer, Sudipto Bari, Vincenzo Barnaba, Joana Barros‐Martins, Dirk Baumjohann, Cristian G. Beccaría, David Bernardo, Dominic A. Boardman, Jessica G Borger, Chotima Böttcher, Leonie Brockmann, Marie E. Burns, Dirk H. Busch, Garth Cameron, Ilenia Cammarata, Antonino Cassotta, Yinshui Chang, Fernando G. Chirdo, Eleni Christakou, Luka Čičin‐Šain, Laura Cook, Alexandra J. Corbett, Rebecca Cornelis, Lorenzo Cosmi, Martin S. Davey, Sara De Biasi, Gabriele De Simone, Genny Del Zotto, Michael Delacher, Francesca Di Rosa, James P. Di Santo, Andreas Diefenbach, Jun Dong, Thomas Dörner, Regine J. Dress, Charles‐Antoine Dutertre, Sidonia B. G. Eckle, Pascale Eede, Maximilien Evrard, Christine S. Falk, Markus Feuerer, Simon Fillatreau, Aida Fiz‐López, Marie Follo, Gemma A. Foulds, Julia Fröbel, Nicola Gagliani, Giovanni Galletti, Anastasia Gangaev, Natalio Garbi, José Antonio Garrote, Jens Geginat, Nicholas A. Gherardin, Lara Gibellini, Florent Ginhoux, Dale I. Godfrey, Paola Gruarin, Claudia Haftmann, Leo Hansmann, Christopher M. Harpur, Adrian Hayday, Guido Heine, Daniela Hernandez, Martin Herrmann, Oliver Hoelsken, Qing Huang, Samuel Huber, Johanna E. Huber, Jochen Huehn, Michael Hundemer, William Ying Khee Hwang, Matteo Iannacone, Sabine Ivison, Hans‐Martin Jäck, Péter K. Jani, Baerbel Keller, Nina Kessler, Steven L. C. Ketelaars, Laura Knop, Jasmin Knopf, Hui‐Fern Koay, Katja Kobow, Katharina Kriegsmann, Hendy Kristyanto, Andreas Krueger, J.F. Kuehne, Heike Kunze‐Schumacher, Pia Kvistborg, Immanuel Kwok, Daniela Latorre, Daniel Lenz, Megan K. Levings, Andreia C. Lino, Francesco Liotta, Heather M. Long, Enrico Lugli, Katherine N. MacDonald, Laura Maggi, Mala K. Maini, Florian Mair, Calin Manta, Rudolf A. Manz, Mir‐Farzin Mashreghi, Alessio Mazzoni, James McCluskey, Henrik E. Mei, Fritz Melchers, Susanne Melzer, Dirk Mielenz, Leticia Monin, Lorenzo Moretta, Gabriele Multhoff, Luis E. Muñoz, Miguel Muñoz‐Ruiz, Franziska Muscate, Ambra Natalini, Katrin Neumann, Lai Guan Ng, Antonia Niedobitek, Jana Niemz, Larissa N. Almeida, Samuele Notarbartolo, Lennard Ostendorf, Laura J. Pallett, Amit A. Patel, Gülce Itır Perçin, Giovanna Peruzzi, Marcello Pinti, A. Graham Pockley, Katharina Pracht, Immo Prinz, Irma Pujol‐Autonell, Nadia Pulvirenti, Linda Quatrini, Kylie M. Quinn, Helena Radbruch, Hefin Rhys, Maria B. Rodrigo, Chiara Romagnani, Carina Saggau, Shimon Sakaguchi, Federica Sallusto, Lieke Sanderink, Inga Sandrock, Christine Schauer, Alexander Scheffold, Hans Ulrich Scherer, Matthias Schiemann, Frank A. Schildberg, Kilian Schober, Janina Schoen, Wolfgang Schuh, Thomas Schüler, Axel Schulz, Sebastian Schulz, Julia Schulze, Sonia Simonetti, Jeeshan Singh, Katarzyna Sitnik, Regina Stark, Sarah C. Starossom, Christina Stehle, Franziska Szelinski, Leonard Tan, Attila Tárnok, Julia Tornack, Timothy Tree, Jasper J. P. van Beek, Willem van de Veen, Klaas P. J. M. van Gisbergen, Chiara Vasco, Nikita A. Verheyden, Anouk von Borstel, Kirsten A. Ward‐Hartstonge, Klaus Warnatz, Claudia Waskow, Annika Wiedemann, Anneke Wilharm, James B. Wing, Oliver F. Wirz, Jens Wittner, Jennie H. M. Yang, Juhao Yang

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Immunology · 2021
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilFrancis Crick InstituteCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésFlow cytometryMass cytometryContext (archaeology)BiologyImmunologyCytometryImmune systemComputational biologyPhenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The third edition of Flow Cytometry Guidelines provides the key aspects to consider when performing flow cytometry experiments and includes comprehensive sections describing phenotypes and functional assays of all major human and murine immune cell subsets. Notably, the Guidelines contain helpful tables highlighting phenotypes and key differences between human and murine cells. Another useful feature of this edition is the flow cytometry analysis of clinical samples with examples of flow cytometry applications in the context of autoimmune diseases, cancers as well as acute and chronic infectious diseases. Furthermore, there are sections detailing tips, tricks and pitfalls to avoid. All sections are written and peer-reviewed by leading flow cytometry experts and immunologists, making this edition an essential and state-of-the-art handbook for basic and clinical researchers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,146

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0440,075

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,227
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,142 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations481
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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