MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4200094009 · doi:10.1002/jmv.27539

Roles of the polybasic furin cleavage site of spike protein in SARS‐CoV‐2 replication, pathogenesis, and host immune responses and vaccination

2021· review· en· W4200094009 sur OpenAlexaff
Md. Golzar Hossain, Yan‐Dong Tang, Sharmin Akter, Chunfu Zheng

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Virology · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFurinCleavage (geology)VirologyBiologyViral replicationInfectivityImmune systemVaccinationVirusGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The polybasic furin cleavage site insertion with four amino acid motifs (PRRA) in spike protein's S1/S2 junction site is important in determining viral infectivity, transmission, and host range. However, there is no review so far explaining the effect of the furin cleavage site of the spike protein on SARS-CoV-2 replication and pathogenesis in the host and immune responses and vaccination. Therefore, here we specifically focused on genomic evolution and properties of the cleavage site of spike protein in the context of SARS-CoV-2 followed by its effect on viral entry, replication, and pathogenesis. We also explored whether the spike protein furin cleavage site affected the host immune responses and SARS-CoV-2 vaccination. This review will help to provide novel insights into the effects of polybasic furin cleavage site on the current COVID-19 pandemic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,879
Score d'incertitude au seuil0,718

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Medical VirologyMême sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchTravaux en français237 207