MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4200097930 · doi:10.1101/2021.12.02.470928

The PNUTS-PAD domain recruits MYC to the PNUTS:PP1 phosphatase complex via the oncogenic MYC-MB0 region

2021· preprint· en· W4200097930 sur OpenAlexafffund
Yong Wei, Alexandra Ahlner, Cornelia Redel, Alexander Lemak, Isak Johansson-Åkhe, Scott Houliston, Tristan M. G. Kenney, Aaliya Tamachi, Vivian Morad, Shili Duan, David W. Andrews, Björn Wallner, Maria Sunnerhagen, C.H. Arrowsmith, Linda Z. Penn

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook HospitalStructural Genomics ConsortiumPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Supercomputer Centre, Linköpings UniversitetCanadian Institutes of Health ResearchGenentechCancerfondenNational Science CouncilOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaAVetenskapsrådetPfizerPrincess Margaret Cancer FoundationCanada Research ChairsOntario GenomicsGenome CanadaMcGill UniversityBayer
Mots-clésPhosphorylationProtein subunitPhosphataseBiologyBinding siteCell biologyPlasma protein bindingCancer researchBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Despite MYC dysregulation in most human cancers, strategies to target this potent oncogenic driver remains an urgent unmet need. Recent evidence shows the PP1 phosphatase and its regulatory subunit PNUTS control MYC phosphorylation and stability, however the molecular basis remains unclear. Here we demonstrate that MYC interacts directly with PNUTS through the MYC homology Box 0 (MB0), a highly conserved region recently shown to be important for MYC oncogenic activity. MB0 interacts with PNUTS residues 1-148, a functional unit here termed, P NUTS a mino-terminal d omain (PAD). Using NMR spectroscopy we determined the solution structure of PAD, and characterised its interaction with MYC. Point mutations of residues at the MYC-PNUTS interface significantly weaken their interaction both in vitro and in vivo . These data demonstrate the MB0 binding pocket of the PAD represents an attractive site for pharmacological disruption of the MYC-PNUTS interaction. In Brief Solving the structure of MYC-PNUTS direct interaction reveals how the intrinsically disordered MYC-Box0 (MB0) region anchors into a binding pocket in the N-terminal PAD domain of PNUTS. These data provide insight into the molecular mechanism of how the PNUTS:PP1 phosphatase complex regulates MYC phosphorylation. Highlights A region critical for MYC oncogenesis, MYC-Box0 (MB0), directly interacts with PNUTS P NUTS a mino-terminal d omain (PAD) is a structural domain that interacts with MYC MB0 Mutation of single residues at the interaction interface disrupts MYC-PNUTS binding in cells MYC-PNUTS binding releases MYC intramolecular interactions to enable PP1substrate access

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetProtein Degradation and InhibitorsTravaux en français237 207