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Enregistrement W4200125441 · doi:10.1183/13993003.01652-2021

Chronic lung allograft dysfunction phenotype and prognosis by machine learning CT analysis

2021· article· en· W4200125441 sur OpenAlexaff
Micheal McInnis, Jin Ma, Gauri Rani Karur, Christian Houbois, Liran Levy, Jan Havlín, Eyal Fuchs, Jussi Tikkanen, Chung‐Wai Chow, Ella Huszti, Tereza Martinu

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTransplantation: Methods and Outcomes
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineReceiver operating characteristicBronchiolitis obliteransLungPleural effusionHazard ratioRadiologyLung transplantationInternal medicineConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Chronic lung allograft dysfunction (CLAD) is the principal cause of graft failure in lung transplant recipients and prognosis depends on CLAD phenotype. We used a machine learning computed tomography (CT) lung texture analysis tool at CLAD diagnosis for phenotyping and prognostication compared with radiologist scoring. METHODS: This retrospective study included all adult first double lung transplant patients (January 2010-December 2015) with CLAD (censored December 2019) and inspiratory CT near CLAD diagnosis. The machine learning tool quantified ground-glass opacity, reticulation, hyperlucent lung and pulmonary vessel volume (PVV). Two radiologists scored for ground-glass opacity, reticulation, consolidation, pleural effusion, air trapping and bronchiectasis. Receiver operating characteristic curve analysis was used to evaluate the diagnostic performance of machine learning and radiologist for CLAD phenotype. Multivariable Cox proportional hazards regression analysis for allograft survival controlled for age, sex, native lung disease, cytomegalovirus serostatus and CLAD phenotype. RESULTS: 88 patients were included (57 bronchiolitis obliterans syndrome (BOS), 20 restrictive allograft syndrome (RAS)/mixed and 11 unclassified/undefined) with CT a median 9.5 days from CLAD onset. Radiologist and machine learning parameters phenotyped RAS/mixed with PVV as the strongest indicator (area under the curve (AUC) 0.85). Machine learning hyperlucent lung phenotyped BOS using only inspiratory CT (AUC 0.76). Radiologist and machine learning parameters predicted graft failure in the multivariable analysis, best with PVV (hazard ratio 1.23, 95% CI 1.05-1.44; p=0.01). CONCLUSIONS: Machine learning discriminated between CLAD phenotypes on CT. Both radiologist and machine learning scoring were associated with graft failure, independent of CLAD phenotype. PVV, unique to machine learning, was the strongest in phenotyping and prognostication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,193
Score d'incertitude au seuil0,565

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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