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Enregistrement W4200133593 · doi:10.22319/rmcp.v12i3.5668

Predicción molecular de serotipos de Streptococcus suis aislados de granjas porcinas en México

2021· article· en· W4200133593 sur OpenAlexaff
Arianna Romero Flores, Marcelo Gottschalk, Gabriela Bárcenas Morales, Víctor Quintero Ramírez, Rosario Esperanza Galván Pérez, Rosalba Carreón Nápoles, Ricardo Ramírez R., José Ivan Sánchez‐Betancourt, Abel Ciprián Carrasco, Susana Mendoza‐Elvira

Notice bibliographique

RevueRevista Mexicana de Ciencias Pecuarias · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesDirección General de Asuntos del Personal Académico, Universidad Nacional Autónoma de MéxicoConsejo Nacional de Ciencia y Tecnología
Mots-clésStreptococcus suisSerotypeMultiplex polymerase chain reactionBiologyTypingMicrobiologyVirologyOutbreakPolymerase chain reactionGeneVirulenceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infections caused by Streptococcus suis (S. suis) pose a problem for the pig industry worldwide. Pigs often carry multiple serotypes of S. suis in the upper respiratory tract, where S. suis is frequently isolated from. The clinical diagnosis of the infection is presumptive and is generally based on clinical signs, the age of the animal and macroscopic lesions. In the laboratory, identification of S. suis is performed biochemically, and then, serotyping is performed with antisera to determine the serotype, but these tests can be inconclusive. To date, there are few studies that have documented the presence and diversity of S. suis serotypes in Mexico. In the present study, it was characterized S. suis strains from Mexican pig farms using molecular approaches; samples were first processed by PCR of the gdh gene to detect S. suis. Positive samples were then subjected to a two-step multiplex PCR (cps PCR) to detect and characterize each strain; the first step consisted of a grouping PCR and the second step consisted of a typing PCR. The serotypes detected in the pig farming areas of Mexico included 1/2, 2, 3, 5, 7, 8, 9, 17, and 23. These findings are important for the characterization of serotypes present in Mexico and for outbreak prevention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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