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Enregistrement W4200138153 · doi:10.1186/s13024-021-00491-y

Discrimination of MSA-P and MSA-C by RT-QuIC analysis of olfactory mucosa: the first assessment of assay reproducibility between two specialized laboratories

2021· article· en· W4200138153 sur OpenAlexfundno aff
Connor Bargar, Chiara Maria Giulia De Luca, Grazia Devigili, Antonio Emanuele Elia, Roberto Cilia, Sara Maria Portaleone, Wen Wang, Irene Tramacere, Edoardo Bistaffa, Federico Angelo Cazzaniga, Giovanni Felisati, Giuseppe Legname, Alessio Di Fonzo, Rong Xu, Steven A. Gunzler, Giorgio Giaccone, Roberto Eleopra, Shu Guang Chen, Fabio Moda

Notice bibliographique

RevueMolecular Neurodegeneration · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueOlfactory and Sensory Function Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institutes of HealthMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchMinistero della SaluteWeston Brain InstituteAmerican Parkinson Disease AssociationNational Institute of Neurological Disorders and StrokeAlzheimer's Association
Mots-clésReproducibilityOlfactory mucosaMolecular medicineMedicineNeurologyPathologyNeuroscienceBiomedical engineeringOlfactory systemBiologyInternal medicineChemistryCancerChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: can be detected in the olfactory mucosa (OM) of MSA and PD patients. For this reason, we have performed the first interlaboratory study based on α-synuclein Real-Time Quaking-Induced Conversion (αSyn_RT-QuIC) analysis of OM samples collected from PD and MSA patients with the parkinsonian (MSA-P) and cerebellar (MSA-C) phenotypes. METHODS: OM samples were prospectively collected from patients with a probable diagnosis of MSA-P (n = 20, mean disease duration 4.4 years), MSA-C (n = 10, mean disease duration 4 years), PD (n = 13, mean disease duration 8 years), and healthy control subjects (HS) (n = 11). Each sample was analyzed by αSyn_RT-QuIC in two independent specialized laboratories, one located in Italy (ITA-lab) and one located in the USA (USA-lab). Both laboratories have developed and used harmonized αSyn_RT-QuIC analytical procedures. Results were correlated with demographic and clinical data. RESULTS: The αSyn_RT-QuIC analysis reached a 96% interrater agreement of results (IAR) between laboratories (Kappa = 0.93, 95% CI 0.83-1.00). In particular, αSyn_RT-QuIC seeding activity was found in the OM of 9/13 patients with PD (sensitivity 69%, IAR 100%) and 18/20 patients with MSA-P (sensitivity 90%, IAR 100%). Interestingly, samples collected from patients with MSA-C did not induce αSyn_RT-QuIC seeding activity, except for one subject in USA-lab. Therefore, we found that MSA-P and MSA-C induced opposite effects. Regardless of disease diagnosis, the αSyn_RT-QuIC seeding activity correlated with some clinical parameters, including the rigidity and postural instability. CONCLUSIONS: may serve as a novel biomarker for accurate clinical diagnoses of PD, MSA-P, and MSA-C. Moreover, αSyn_RT-QuIC represents a reliable assay that can distinguish patients with MSA-P from those with MSA-C, and may lead to significant advancements in patients stratification and selection for emerging pharmacological treatments and clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,091

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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