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Enregistrement W4200186188 · doi:10.1101/2021.12.07.21266342

De novo variants in the <i>PSMC3</i> proteasome AAA-ATPase subunit gene cause neurodevelopmental disorders associated with type I interferonopathies

2021· preprint· en· W4200186188 sur OpenAlexaff
Frédéric Ebstein, Sébastien Küry, Victoria Most, Cory Rosenfelt, Marie‐Pier Scott‐Boyer, Geeske M. van Woerden, Thomas Besnard, Jonas Johannes Papendorf, Maja Studencka‐Turski, Tianyun Wang, Tzung‐Chien Hsieh, Richard Golnik, Dustin Baldridge, Cara Forster, Charlotte de Konink, Selina M. W. Teurlings, Virginie Vignard, Richard H. van Jaarsveld, Lesley C. Adès, Benjamin Cogné, Cyril Mignot, Wallid Deb, Marjolijn C.J. Jongmans, F. Sessions Cole, Marie‐José H. van den Boogaard, Jennifer Wambach, Daniel Wegner, Sandra Yang, Vickie Hannig, Jennifer Brault, Neda Zadeh, Bruce Bennetts, Boris Keren, Anne-Claire Gélineau, Zöe Powis, Meghan C. Towne, Kristine Bachman, Andrea Seeley, Anita E. Beck, Jennifer Morrison, Rachel Westman, Kelly Averill, Theresa Brunet, Judith Haasters, Melissa T. Carter, Matthew Osmond, Patricia G. Wheeler, Francesca Forzano, Shehla Mohammed, Yannis Trakadis, Andrea Accogli, Rachel Harrison, Sophie Rondeau, Geneviève Baujat, Giulia Barcia, René G. Feichtinger, Johannes A. Mayr, Martin Preisel, Frédéric Laumonnier, Alexej Knaus, Bertrand Isidor, Peter Krawitz, Uwe Völker, Elke Hammer, Arnaud Droit, Evan E. Eichler, Ype Elgersma, Peter W. Hildebrand, François V. Bolduc, Elke Krüger, Stéphane Bezieau

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of OttawaUniversity of AlbertaUniversité LavalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthSimons FoundationDeutsche ForschungsgemeinschaftAustrian Science FundE-RareSimons Foundation Autism Research InitiativeHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésProteasomeBiologyAAA proteinsUbiquitinProteostasisInnate immune systemProtein subunitGeneticsProtein degradationUnfolded protein responseCell biologyGeneATPaseImmune systemBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A critical step in preserving protein homeostasis by the ubiquitin-proteasome system (UPS) is the recognition, binding, unfolding, and translocation of protein substrates by AAA-ATPase proteasome subunits for degradation by 26S proteasomes. Here, we identified fourteen different de novo missense variants in the PSMC3 gene encoding the AAA-ATPase proteasome subunit Rpt5 in twenty-two unrelated heterozygous subjects with an autosomal dominant form of neurodevelopmental delay and intellectual disability. Indeed, depletion of PSMC3 impaired reversal learning capabilities in a Drosophila model. The PSMC3 variants cause proteasome dysfunction in patient-derived cells by disruption of substrate translocation, proteotoxic stress and proteostatic imbalances, as well as alterations in proteins controlling developmental and innate immune programs. Molecular analysis confirmed the induction of cellular stress responses and dysregulated mitophagy along with an elevated type I interferon (IFN) signature. Our data define PSMC3 variants as the genetic cause of proteotoxic stress alerting the innate immune system to mount a type I IFN response and link neurodevelopmental syndromes to interferonopathies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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