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Enregistrement W4200238765 · doi:10.1093/nar/gkab1241

Membrane-dependent relief of translation elongation arrest on pseudouridine- and <i>N</i>1-methyl-pseudouridine-modified mRNAs

2021· article· en· W4200238765 sur OpenAlexafffund
Yuri V. Svitkin, Anne‐Claude Gingras, Nahum Sonenberg

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensSinai Health SystemLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPseudouridinePolysomeBiologyTranslation (biology)RibosomeMessenger RNAProtein biosynthesisLuciferaseCell biologyReticulocyteRNAMolecular biologyBiochemistryTransfer RNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression of therapeutically important proteins has benefited dramatically from the advent of chemically modified mRNAs that feature decreased lability and immunogenicity. This had a momentous effect on the rapid development of COVID-19 mRNA vaccines. Incorporation of the naturally occurring pseudouridine (Ψ) or N1-methyl-pseudouridine (N1mΨ) into in vitro transcribed mRNAs prevents the activation of unwanted immune responses by blocking eIF2α phosphorylation, which inhibits translation. Here, we report that Ψs in luciferase (Luc) mRNA exacerbate translation pausing in nuclease-untreated rabbit reticulocyte lysate (uRRL) and promote the formation of high-order-ribosome structures. The major deceleration of elongation occurs at the Ψ-rich nucleotides 1294-1326 of Ψ-Luc mRNA and results in premature termination of translation. The impairment of translation is mainly due to the shortage of membranous components. Supplementing uRRL with canine microsomal membranes (CMMs) relaxes the impediments to ribosome movement, resolves collided ribosomes, and greatly enhances full-size luciferase production. CMMs also strongly stimulated an extremely inefficient translation of N1mΨ-Luc mRNA in uRRL. Evidence is presented that translational pausing can promote membrane recruitment of polysomes with nascent polypeptides that lack a signal sequence. Our results highlight an underappreciated role of membrane binding to polysomes in the prevention of ribosome collision and premature release of nascent polypeptides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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