New Variants of the Cytochrome P450 2R1 (CYP2R1) Gene in Individuals with Severe Vitamin D-Activating Enzyme 25(OH)D Deficiency
Notice bibliographique
Résumé
Background: Vitamin D is a fat-soluble cholesterol derivative found in two forms, vitamin D2, and vitamin D3. Cytochrome P450 2R1 (CYP2R1) encoded by the CYP2R1 gene is the major hydroxylase that activates vitamin D by catalyzing the formation of 25-hydroxyvitamin D (25(OH)D). Methods: We collected 89 (100%) subjects, 46 of which (51.69%) had a documented severe deficiency of 25(OH)D (<10 ng/mL) and 43 (48.31%) in the control group with documented optimum levels of 25(OH)D (>30 ng/mL). We performed Sanger sequencing of three selected fragments of the CYP2R1 gene (Ch11: 14878000–14878499; Ch11: 14880058–14880883 and Ch11: 14885321–14886113) that affect the binding of substrates to this enzyme and analyzed the possible involvement of genetic variation in these regions with an increased risk of vitamin D deficiency in healthy Polish individuals. Results: Two substitutions were found within the three fragments. Bioinformatic analysis suggested that one of these (NC_000011.10: g.14878291G>A) may influence the structure and function of CYP2R1. Conclusions: Variant NC_000011.10: g.14878291G>A may have a perturbing effect on heme binding in the active site of CYP2R1 and on the function of 25-hydroxylase and probably affects the concentration of 25(OH)D in vivo. We intend to perform functional verification in a larger patient population to confirm and extend these results.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».