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Enregistrement W4200267551 · doi:10.1002/cpz1.320

Using hiPSC‐CMs to Examine Mechanisms of Catecholaminergic Polymorphic Ventricular Tachycardia

2021· article· en· W4200267551 sur OpenAlexafffund
Alia Arslanova, Sanam Shafaattalab, Kevin Ye, Parisa Asghari, Lisa Y. Lin, BaRun Kim, Thomas M. Roston, Leif Hove‐Madsen, Filip Van Petegem, Shubhayan Sanatani, E.Neil Moore, Francis C. Lynn, Mads T. Søndergaard, Yonglun Luo, S.R. Wayne Chen, Glen F. Tibbits

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of British ColumbiaBC Children's HospitalUniversity of CalgarySimon Fraser University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchSteno Diabetes Center AarhusStem Cell Network
Mots-clésCatecholaminergic polymorphic ventricular tachycardiaCatecholaminergicInternal medicineCardiologyMedicineVentricular tachycardiaDopamineRyanodine receptor 2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia (CPVT) is a potentially lethal inherited cardiac arrhythmia condition, triggered by physical or acute emotional stress, that predominantly expresses early in life. Gain‐of‐function mutations in the cardiac ryanodine receptor gene (RYR2) account for the majority of CPVT cases, causing substantial disruption of intracellular calcium (Ca2+) homeostasis particularly during the periods of β‐adrenergic receptor stimulation. However, the highly variable penetrance, patient outcomes, and drug responses observed in clinical practice remain unexplained, even for patients with well‐established founder RyR2 mutations. Therefore, investigation of the electrophysiological consequences of CPVT‐causing RyR2 mutations is crucial to better understand the pathophysiology of the disease. The development of strategies for reprogramming human somatic cells to human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) has provided a unique opportunity to study inherited arrhythmias, due to the ability of hiPSCs to differentiate down a cardiac lineage. Employment of genome editing enables generation of disease‐specific cell lines from healthy and diseased patient‐derived hiPSCs, which subsequently can be differentiated into cardiomyocytes. This paper describes the means for establishing an hiPSC‐based model of CPVT in order to recapitulate the disease phenotype in vitro and investigate underlying pathophysiological mechanisms. The framework of this approach has the potential to contribute to disease modeling and personalized medicine using hiPSC‐derived cardiomyocytes. © 2021 Wiley Periodicals LLC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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