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Enregistrement W4200304327 · doi:10.14814/phy2.15142

Surgical trauma is associated with renal immune cell activation in rats: A microarray study

2021· article· en· W4200304327 sur OpenAlexafffund
Michael Hultström, Di Peng, Mediha Becirovic‐Agic, Claire G. Cupples, William A. Cupples, Nicholas Mitrou

Notice bibliographique

RevuePhysiological Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Kidney Injury Research
Établissements canadiensWestern UniversitySimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchStiftelsen Lars Hiertas MinneSvenska LäkaresällskapetÅke Wiberg StiftelseHjärt-LungfondenMagnus Bergvalls StiftelseSvenska Sällskapet för Medicinsk Forskning
Mots-clésImmune systemMedicineMicroarrayMicroarray analysis techniquesInflammationKidneyGene expressionPerioperativeImmunohistochemistryInfiltration (HVAC)CellImmunologyPathologyAndrologyBiologyGeneInternal medicineSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acute kidney injury (AKI) is a common perioperative complication that is associated with increased mortality. This study investigates the renal gene expression in male Long–Evans rats after prolonged anesthesia and surgery to detect molecular mechanisms that could predispose the kidneys to injury upon further insults. Healthy and streptozotocin diabetic rats that underwent autoregulatory investigation in an earlier study were compared to rats that were sacrificed quickly for mRNA quantification in the same study. Prolonged surgery caused massive changes in renal mRNA expression by microarray analysis, which was validated by quantitative real-time PCR with good correlation. Furthermore, bioinformatics analysis using gene ontology and pathway analysis identified biological processes involved in immune system activation, such as immune system processes (p = 1.3 × 10−80), immune response (p = 1.3 × 10−60), and regulation of cytokine production (p = 1.7 × 10−52). PCR analysis of specific cell type markers indicated that the gene activation in kidneys was most probably macrophages, while granulocytes and T cell appeared less activated. Immunohistochemistry was used to quantify immune cell infiltration and showed no difference between groups indicating that the genetic activation depends on the activation of resident cells, or infiltration of a relatively small number of highly activated cells. In follow-up experiments, surgery was performed on healthy rats under standard and sterile condition showing similar expression of immune cell markers, which suggests that the inflammation was indeed caused by the surgical trauma rather than by bacterial infection. In conclusion, surgical trauma is associated with rapid activation of immune cells, most likely macrophages in rat kidneys.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,585
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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