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Enregistrement W4200311443 · doi:10.1101/2021.12.12.471765

Glycine targets NINJ1-mediated plasma membrane rupture to provide cytoprotection

2021· preprint· en· W4200311443 sur OpenAlexaff
Jazlyn P. Borges, Ragnhild SR Sætra, Allen Volchuk, Marit Bugge, Bridget R Kilburn, Neil M. Goldenberg, Trude Helen Flo, Benjamin E. Steinberg

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytoprotectionCell biologyGlycineProgrammed cell deathApoptosisChemistryBiologyBiochemistryAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract First recognized 35 years ago, glycine is known to protect cells against plasma membrane rupture from diverse types of tissue injury. This robust and widely observed effect has been speculated to target a late downstream process common to multiple modes of tissue injury. The molecular target of glycine cytoprotection, however, remains entirely elusive. We hypothesized that glycine targets ninjurin-1 (NINJ1), a newly identified executioner of plasma membrane rupture in pyroptosis, necrosis, and post-apoptotic cell death. NINJ1 is thought to cluster within the plasma membrane to cause cell rupture. Here, we first demonstrate that NINJ1 knockout functionally and morphologically phenocopies glycine cytoprotection in mouse and human macrophages stimulated to undergo lytic cell death. Next, we show that glycine treatment prevents NINJ1 clustering thereby preserving cellular integrity. By identifying NINJ1 as a glycine target, our data help resolve a long-standing mechanism of glycine cytoprotection. This new understanding will inform the development of cell preservation strategies to counter pathologic lytic cell death pathways. Graphical abstract Summary Glycine is known to protect cells against plasma membrane rupture from diverse types of tissue injury by an unknown mechanism. The authors demonstrate that NINJ1, a newly identified executioner of plasma membrane rupture across lytic cell death pathways, is a glycine target and resolve a longstanding mechanism of glycine cytoprotection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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