A Mechanistic Study on the Non‐enzymatic Hydrolysis of Kdn Glycosides
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Sialic acids are biologically important carbohydrates that are prevalent throughout nature. We are interested in their intrinsic reactivity in aqueous solution and how such reactivity affects the design of substrates for investigation of enzymes that process these sugars. To probe the reactivity differences between two sialic acid family members N‐acetylneuraminic acid and Kdn we measured the rate constants for hydrolysis of 4‐nitrophenyl 3‐deoxy‐d‐glycero‐α‐d‐galacto‐non‐2‐ulosonide in aqueous solution. The kinetic data is consistent with glycosidic C−O bond cleavage occurring via four mechanistic pathways, and these are: (i) hydronium ion‐catalyzed hydrolysis of the neutral sugar; (ii) hydronium ion‐catalyzed hydrolysis of the glycosidic carboxylate; (iii) water‐catalyzed hydrolysis of the anionic glycoside; and (iv) base‐promoted reaction of the anionic glycoside. To study the effects of C‐5 substitution on the Kdn glycoside we made 4‐nitrophenyl 5‐O‐methyl‐α‐Kdn glycoside and determined its rate constants for hydrolysis. All hydrolytic rate constants for both Kdn glycosides were larger than those reported for the parent N‐acetyl‐α‐neuraminide. The water‐catalyzed reaction (pathway iii) exhibited a βlg value of −1.3±0.1. We conclude that the larger rate constants associated with C5‐oxygen containing sialosides results from less steric congestion at the hydrolytic transition states than for the parent C‐5 acetamido glycoside.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».