1361. <i>Actinotignum schaalii</i> an Under-recognized Cause of Infections: A Case Series in Calgary from 2012 - 2020
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Actinotignum schaalii is a gram-positive rod that is a fastidious commensal of the urogenital tract. Infections with A. schaalii are underdiagnosed previously because phenotypic methods fail to identify it. Both MALDI-TOF mass spectrometry and 16S rRNA sequencing allow definitive identification of this opportunistic emerging pathogen. A. schaalii is an infrequent but important cause of UTIs in the elderly, particularly with urological abnormalities. The spectrum of invasive disease caused by A. schaalii is not well characterized; however, it has been isolated in severe infections including necrotizing skin and soft tissue infections, bacteremia, osteomyelitis, and endocarditis. We used a population-based approach to characterize and describe the clinical and microbiological features of invasive A. schaalii infections in our region. Methods All adult and pediatric cases enrolled had microbiological isolates of Actinotignum schaalii recovered from blood cultures, sterile fluids and tissue cultures from Jan 2012 to Dec 2020 by APL, a regional centralized microbiology laboratory serving the Calgary Zone in Alberta, Canada. Clinical data were retrieved and linked from administrative health databases, chart review and the laboratory information system. Standard descriptive statistics were used. Results We identified 84 unique A. schaalii infections, 35 were from bloodstream, 32 soft tissue, 7 post-operative infections. Median age and Charslon comorbidity score was higher in BSI. 54.3% of patient with BSI had a genitourinary pathology, with 51.4% caused by a complicated urinary infection, while soft and skin tissue infections caused 65.3% of non-BSI. Using EUCAST MIC cut-offs, 48% and 100% of the isolates were resistant to clindamycin and metronidazole, respectively. In contrast, all specimens were susceptible to penicillin. Hospitalization and 90-days mortality were higher in the BSI group. Conclusion A. schaalii is an anaerobic opportunistic pathogen that can cause life-threatening invasive infections, particularly in older adults with underlying genitourinary pathology. BSI were associated with higher rates of hospitalization and mortality. In contrast, patients with A. schaalii isolated from cutaneous sources were younger and had better clinical outcomes. Disclosures All Authors: No reported disclosures
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».