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Enregistrement W4200389440 · doi:10.1101/2021.12.06.21267383

Data and code availability statements in systematic reviews of interventions were often missing or inaccurate: a content analysis

2021· preprint· en· W4200389440 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilAustralian GovernmentUniversity of Ottawa
Mots-clésComputer scienceCitationSystematic reviewScopusCode reviewInformation retrievalDownloadSample (material)Raw dataData fileData scienceWorld Wide WebSoftwareMEDLINESoftware qualityDatabaseSoftware development

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives: To estimate the frequency of data and code availability statements in a random sample of systematic reviews with meta-analysis of aggregate data, summarise the content of the statements and investigate how often data and code files were shared. Methods: We searched for systematic reviews with meta-analysis of aggregate data on the effects of a health, social, behavioural or educational intervention that were indexed in PubMed, Education Collection via ProQuest, Scopus via Elsevier, and Social Sciences Citation Index and Science Citation Index Expanded via Web of Science during a four-week period (between November 2nd and December 2nd, 2020). Records were randomly sorted and screened independently by two authors until our target sample of 300 systematic reviews was reached. Two authors independently recorded whether a data or code availability statement (or both) appeared in each review and coded the content of the statements using an inductive approach. Results: Of the 300 included systematic reviews with meta-analysis, 86 (29%) had a data availability statement and seven (2%) had both a data and code availability statement. In 12/93 (13%) data availability statements, authors stated that data files were available for download from the journal website or a data repository, which we verified as being true. While 39/93 (42%) authors stated data were available upon request, 37/93 (40%) implied that sharing of data files was not necessary or applicable to them, most often because "all data appear in the article" or "no datasets were generated or analysed". Discussion: Data and code availability statements appear infrequently in systematic review manuscripts. Authors who do provide a data availability statement often incorrectly imply that data sharing is not applicable to systematic reviews. Our results suggest the need for various interventions to increase data and code sharing by systematic reviewers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaMétarecherche
Domaine: Reproductibilité · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnellow
gptMétarechercheScience ouverte
Domaine: Présentation des résultats · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnelmedium
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,278
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,181
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Méta-épidémiologie (sens large), Communication savante, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,335
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2780,181
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0160,004
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,932
Tête enseignante GPT0,619
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle