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Enregistrement W4200414160 · doi:10.7554/elife.73430

Experiments from unfinished Registered Reports in the Reproducibility Project: Cancer Biology

2021· article· en· W4200414160 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeLife · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensKinexus Bioinformatics Corporation (Canada)University of British ColumbiaApplied Biological Materials (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésReproducibilityReplication (statistics)ReplicateCancerExperimental biologyPreclinical research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As part of the Reproducibility Project: Cancer Biology , we published Registered Reports that described how we intended to replicate selected experiments from 29 high-impact preclinical cancer biology papers published between 2010 and 2012. Replication experiments were completed and Replication Studies reporting the results were submitted for 18 papers, of which 17 were accepted and published by eLife with the rejected paper posted as a preprint. Here, we report the status and outcomes obtained for the remaining 11 papers. Four papers initiated experimental work but were stopped without any experimental outcomes. Two papers resulted in incomplete outcomes due to unanticipated challenges when conducting the experiments. For the remaining five papers only some of the experiments were completed with the other experiments incomplete due to mundane technical or unanticipated methodological challenges. The experiments from these papers, along with the other experiments attempted as part of the Reproducibility Project: Cancer Biology, provides evidence about the challenges of repeating preclinical cancer biology experiments and the replicability of the completed experiments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,082
Score d'incertitude au seuil0,353

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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