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Enregistrement W4200418197 · doi:10.1093/ofid/ofab466.945

748. The Changing Epidemiology of <i>Clostridioides difficile</i> Infection and the NAP1/027 Strain in Two Quebec Hospitals

2021· article· en· W4200418197 sur OpenAlexaffabout
Sandrine Couture, Charles Frenette, Rowin Alfaro, Lorne Schweitzer, Ian Schiller, Nancy Doherty, Rahul Nanda, Yves Longtin, Daniel J. G. Thirion, Vivian G. Loo

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General HospitalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineClostridioidesIncidence (geometry)Infection controlEpidemiologyPsychological interventionRibotypingInternal medicineGenotypingEmergency medicinePediatricsGenotypeSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background In 2003, many hospitals in Québec, Canada experienced an increase in the incidence of healthcare-associated C. difficile infection (HA-CDI) associated with increased morbidity and mortality. This increase was associated with the dissemination of the NAP1/027 strain. The objective of this study was to describe the epidemiology of HA-CDI in two tertiary care hospitals based in Montréal from 2003 to 2019. Methods Surveillance for HA-CDI was performed using standard definitions from 2003 to 2019 at the Montreal General Hospital (MGH) and Royal Victoria Hospital (RVH), in Montréal, Québec. C. difficile was isolated from stool specimens using standard methods. Pulsed field gel electrophoresis and ribotyping were performed to determine genotype. Antibiotic utilization and infection control interventions implemented over the same time period were reviewed. Results A total of 4314 cases of CDAD were identified during the study period: 2295 at the RVH and 2019 at the MGH. The incidence decreased from 29.5 to 5.9 cases per 10,000 patient-days between 2003 and 2019 at the RVH and from 23.8 to 3.9 cases per 10,000 patient-days at the MGH. Of the 124 isolates available for genotyping in 2003, 112 were NAP1 (90.3%) compared to 5 out of 53 (9.4%) in 2019. Fluoroquinolone utilization decreased from 230 to 139 DDDs per 1,000 patient-days between 2003 and 2019, whereas total antibiotic utilization increased from 1296 to 1550 DDDs per 1,000 patient-days. Infection Control interventions included empirically placing patients with diarrhea on precautions, intensified cleaning measures, formal antibiotic stewardship, introduction of a real-time PCR C. difficile test in June 2010, and a move to a facility with only single rooms at the RVH in April 2015. Incidence of HA-CDI at the RVH and MGH and antibiotic utilization between 2003 and 2019 Conclusion An important change in HA-CDI epidemiology was observed in two Canadian tertiary care hospitals based in Montréal between 2003 and 2019. There was a significant decrease in incidence of HA-CDI and a genotype shift from a predominance of NAP1 strains to non-NAP1 strains. Utilization of fluoroquinolones, to which the NAP1 strain is resistant, concurrently decreased. Infection control interventions targeting isolation, diagnosis, disinfection, and antibiotic stewardship have contributed to the major observed reduction in HA-CDI incidence. Disclosures All Authors: No reported disclosures

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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