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Enregistrement W4200420860 · doi:10.1093/ofid/ofab466.634

435. Outcomes for E484K Mutation Negative COVID-19 Patients Cohorted with E484K Mutation Positive COVID-19 Patients: A Retrospective Cohort Study

2021· article· en· W4200420860 sur OpenAlexaff
Fahad Buskandar, Amber L Linkneheld-Struk, Victoria R. Williams, Adrienne K. Chan, Lorraine Maze Dit Mieusement, Natasha Salt, Jerome A. Leis

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune responses and vaccinations
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineRetrospective cohort studyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Internal medicineCohortCohort studyMutationPediatricsDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The emergence of the E484K mutation of SARS-CoV-2 poses a risk of immune evasion but the risk of re-infection during acute infection is not well defined. Our aim was to assess the risk of re-infection among patients with existing acute E484K mutation negative COVID-19 infection who were exposed to an E484K mutation positive SARS-CoV-2 infected patient. Methods We performed a retrospective cohort study of patients admitted with acute E484K negative COVID-19 infection and shared a hospital room with a patient who was E484K mutation positive during their period of communicability. The primary outcome was laboratory confirmed and/or clinical evidence of re-infection within the E484K negative population within 30 days of exposure and the secondary outcome was the 30-day risk of death or re-admission to hospital due to COVID-19. Results We identified 41 patients who were E484K mutation negative who shared a hospital room with some of the identified 34 E484K positive patients. Six (14%) underwent repeat COVID-19 testing and remained E484K negative and none developed signs or symptoms of COVID-19 re-infection during the 30 days following exposure. The mortality rate was 7% (3/41) and re-admission rate was zero at 30 days from exposure. Conclusion Despite the small sample size, we did not observe any evidence of re-infection among patients with COVID-19 who shared a hospital room with E484K positive patients during their acute infection. If necessary due to high hospital occupancy, patients with discordant E484K results can be safely cohorted in a shared room. Disclosures All Authors: No reported disclosures

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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