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Enregistrement W4200427615 · doi:10.1186/s13148-021-01209-z

DNA methylation mediates the association between breastfeeding and early-life growth trajectories

2021· article· en· W4200427615 sur OpenAlexafffund
Laurent Briollais, Denis Rustand, Catherine Allard, Yanyan Wu, Jingxiong Xu, Samyukta Govinda Rajan, Marie‐France Hivert, Myriam Doyon, Luigi Bouchard, Patrick O. McGowan, Steven Matthews, Steven Lye

Notice bibliographique

RevueClinical Epigenetics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanUniversité de SherbrookeCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeSinai Health SystemUniversity of TorontoThe Scarborough HospitalPublic Health OntarioLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcomeMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchWellcome Trust
Mots-clésDNA methylationHuman geneticsBreastfeedingAssociation (psychology)GeneticsBiologyDNAMethylationReproductive medicineMedicineBioinformaticsComputational biologyGenePsychologyPregnancyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The role of breastfeeding in modulating epigenetic factors has been suggested as a possible mechanism conferring its benefits on child development but it lacks evidence. Using extensive DNA methylation data from the ALSPAC child cohort, we characterized the genome-wide landscape of DNA methylation variations associated with the duration of exclusive breastfeeding and assessed whether these variations mediate the association between exclusive breastfeeding and BMI over different epochs of child growth. RESULTS: Exclusive breastfeeding elicits more substantial DNA methylation variations during infancy than at other periods of child growth. At the genome-wide level, 13 CpG sites in girls (miR-21, SNAPC3, ATP6V0A1, DHX15/PPARGC1A, LINC00398/ALOX5AP, FAM238C, NATP/NAT2, CUX1, TRAPPC9, OSBPL1A, ZNF185, FAM84A, PDPK1) and 2 CpG sites in boys (IL16 and NREP), mediate the association between exclusive breastfeeding and longitudinal BMI. We found enrichment of CpG sites located within miRNAs and key pathways (AMPK signaling pathway, insulin signaling pathway, endocytosis). Overall DNA methylation variation corresponding to 3 to 5 months of exclusive breastfeeding was associated with slower BMI growth the first 6 years of life compared to no breastfeeding and in a dose-response manner with exclusive breastfeeding duration. CONCLUSIONS: Our study confirmed the early postnatal period as a critical developmental period associated with substantial DNA methylation variations, which in turn could mitigate the development of overweight and obesity from infancy to early childhood. Since an accelerated growth during these developmental periods has been linked to the development of sustained obesity later in life, exclusive breastfeeding could have a major role in preventing the risks of overweight/obesity and children and adults through DNA methylation mechanisms occurring early in life.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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