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Enregistrement W4200452299 · doi:10.1093/ofid/ofab466.1408

1216. Presence of the Narrow-Spectrum OXA-1 Beta-lactamase Enzyme Is Associated with Elevated Piperacillin-Tazobactam MIC Values Among ESBL-producing <i>Escherichia coli</i> Clinical Isolates (CANWARD, 2007-2018)

2021· article· en· W4200452299 sur OpenAlexaffabout
Andrew Walkty, James A. Karlowsky, Philippe Lagacé‐Wiens, Alyssa Golden, Melanie Baxter, Andrew Denisuik, Melissa McCracken, Michael R. Mulvey, Heather J. Adam, George G. Zhanel

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of ManitobaManitoba Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPiperacillinBeta-lactamaseTazobactamPiperacillin/tazobactamBroth microdilutionMicrobiologyEscherichia coliMedicineEnterobacteriaceaeBeta-Lactamase InhibitorsAntibioticsBiologyMinimum inhibitory concentrationGeneBacteriaAntibiotic resistanceImipenemGeneticsPseudomonas aeruginosa

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The clinical outcome of patients with bacteremia due to an extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing member of the family Enterobacteriaceae who are treated with piperacillin-tazobactam appears to depend, at least in part, on the piperacillin-tazobactam MIC. The purpose of this study was to determine whether there is any association between the MIC of piperacillin-tazobactam and presence of the narrow spectrum OXA-1 beta-lactamase enzyme among ESBL-producing Escherichia coli. Methods E. coli clinical isolates were obtained from patients evaluated at hospitals across Canada (January 2007 to December 2018) as part of an ongoing national surveillance study (CANWARD). ESBL production was confirmed using the Clinical and Laboratory Standards Institute phenotypic method. Susceptibility testing was carried out using custom broth microdilution panels, and all isolates underwent whole genome sequencing for beta-lactamase gene detection. Results In total, 671 ESBL-producing E. coli were identified as part of the CANWARD study. The majority of isolates (92.0%; 617/671) harbored a CTX-M ESBL enzyme. CTX-M-15 (62.3%; 418/671), CTX-M-27 (13.9%; 93/671), and CTX-M-14 (13.4%; 90/671) were the most common variants identified. The narrow spectrum OXA-1 beta-lactamase enzyme was present in 42.6% (286/671) of isolates. OXA-1 was detected in 66.3% (277/418) of isolates with a CTX-M-15 ESBL enzyme versus only 3.6% (9/253) of isolates with other ESBL enzyme types. The piperacillin-tazobactam MIC50 and MIC90 values were 8 µg/mL and 32 µg/mL for isolates that possessed the OXA-1 enzyme versus 2 μg/mL and 8 µg/mL for those that did not. The percentage of ESBL-producing E. coli isolates that were inhibited by a piperacillin-tazobactam MIC of ≤8 μg/mL was 68.5% for isolates that were OXA-1 positive and 93.8% for isolates that were OXA-1 negative. Conclusion The MIC50 and MIC90 values of piperacillin-tazobactam among ESBL-producing E. coli were higher for the subset of isolates that harbored a narrow spectrum OXA-1 beta-lactamase enzyme relative to the subset that did not. This association was primarily observed among ESBL-producers with the CTX-M-15 enzyme variant. OXA-1 was infrequently detected among isolates with other ESBL enzyme types. Disclosures George Zhanel, PhD, AVIR (Grant/Research Support)Iterum (Grant/Research Support)Merck (Grant/Research Support)Pfizer (Grant/Research Support)Sandoz (Grant/Research Support)Sunovion (Grant/Research Support)Venatorx (Grant/Research Support)Verity (Grant/Research Support)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,281
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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