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Enregistrement W4200456620 · doi:10.1371/journal.pbio.3001492

Ultradian rhythms of AKT phosphorylation and gene expression emerge in the absence of the circadian clock components Per1 and Per2

2021· article· en· W4200456620 sur OpenAlexfundno aff
Rona Aviram, Vaishnavi Dandavate, Gal Manella, Marina Golik, Gad Asher

Notice bibliographique

RevuePLoS Biology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilAbisch-Frenkel-StiftungAzrieli Foundation
Mots-clésPER1Ultradian rhythmBiologyPER2Circadian rhythmCircadian clockProtein kinase BCLOCKInternal medicineEndocrinologyCell biologyPhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rhythmicity of biological processes can be elicited either in response to environmental cycles or driven by endogenous oscillators. In mammals, the circadian clock drives about 24-hour rhythms of multitude metabolic and physiological processes in anticipation to environmental daily oscillations. Also at the intersection of environment and metabolism is the protein kinase-AKT. It conveys extracellular signals, primarily feeding-related signals, to regulate various key cellular functions. Previous studies in mice identified rhythmicity in AKT activation (pAKT) with elevated levels in the fed state. However, it is still unknown whether rhythmic AKT activation can be driven through intrinsic mechanisms. Here, we inspected temporal changes in pAKT levels both in cultured cells and animal models. In cultured cells, pAKT levels showed circadian oscillations similar to those observed in livers of wild-type mice under free-running conditions. Unexpectedly, in livers of Per1,2-/- but not of Bmal1-/- mice we detected ultradian (about 16 hours) oscillations of pAKT levels. Importantly, the liver transcriptome of Per1,2-/- mice also showed ultradian rhythms, corresponding to pAKT rhythmicity and consisting of AKT-related genes and regulators. Overall, our findings reveal ultradian rhythms in liver gene expression and AKT phosphorylation that emerge in the absence of environmental rhythms and Per1,2-/- genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,205
Score d'incertitude au seuil0,212

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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