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Enregistrement W4200470952 · doi:10.1093/ofid/ofab466.1403

1211. Incidence of All-Cause Community-Acquired Pneumonia in Ontario and British Columbia, Canada, 2002-2018; a Canadian Immunization Research Network (CIRN) study

2021· article· en· W4200470952 sur OpenAlexaffabout
Sharifa Nasreen, John Wang, Jeffrey C. Kwong, Natasha S. Crowcroft, Manish Sadarangani, Sarah E. Wilson, Allison McGeer, James D. Kellner, Caroline Quach, Shaun K. Morris, Shelly Bolotin, Beate Sander, Monika Naus, Linda Hoang, Frank Rudzicz, Shaza A. Fadel, Fawziah Marra

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Clinical Evaluative SciencesUniversity of CalgaryBC Centre for Disease ControlHospital for Sick ChildrenUniversity of British ColumbiaPublic Health OntarioUniversity Health NetworkSickKids FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineIncidence (geometry)PopulationDemographyCommunity-acquired pneumoniaPneumococcal conjugate vaccinePoisson regressionPneumoniaConfidence intervalPediatricsStreptococcus pneumoniaeEnvironmental healthInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Community-acquired pneumonia (CAP) causes substantial morbidity and mortality. There is a lack of data on the comprehensive burden of CAP across the life span in Canada. We estimated the incidence of all-cause CAP in all age groups in Ontario and British Columbia (BC), Canada. Methods We identified hospitalized and outpatient CAP episodes from the Discharge Abstract Database (DAD) and physician billing claims databases (Ontario Health Insurance Plan in Ontario and Medical Services Plan in BC) in both provinces. The National Ambulatory Care Reporting System was used to identify CAP episodes from emergency department visits in Ontario. CAP recorded with a primary or secondary diagnosis was identified using International Classification of Diseases 9 (480–486, 510, 513) and 10 (J10.0, J11.0, J12–J18, J86.9, J85.1) codes. We estimated the age and sex adjusted annual incidence of CAP overall, and by age groups (0–4, 5–17, 18–39, 40–64, 65–74, 75–84 and ≥85 years) according to routine childhood pneumococcal conjugate vaccine (PCV) immunization periods from 2005–2018 in Ontario and from 2002–2018 in BC. Poisson regression models were fitted with population denominators from Statistics Canada to estimate the incidence rates. Results Ontario had 3,607,186 CAP episodes from 2005–2015 with a mean annual incidence of 2,801 (95% confidence interval [CI]: 2,748, 2,854) per 100,000 population; incidence declined from 3,077/100,000 in 2005 to 2,604/100,000 in 2010 before increasing to 2,843/100,000 in 2018. BC had 1,146,172 CAP episodes from 2002–2008, with a mean annual incidence of 2,146 (95% CI: 2105, 2189); the incidence increased from 2,005 /100,000 in 2002 to 2,199/100,000 in 2018. A high incidence of CAP was observed in children aged 0–4 years and older adults, particularly in adults aged ≥85 years in both provinces across all PCV program periods (Figure 1). Figure 1: Age group-specific incidence of all-cause community-acquired pneumonia according to childhood pneumococcal conjugate vaccine (PCV) program periods in Ontario (PCV7 [1 Jan 2005–30 Sep 2009]), PCV10 [1 Oct 2009–31 Oct 2010] and PCV13 [1 Nov 2010–31 Dec 2018]) and British Columbia (PCV7 [1 Sep 2003–31 May 2010] and PCV13 [1 Jun 2010–31 Dec 2018]), Canada Conclusion CAP continues to be a public health burden in Canada despite publicly funded pneumococcal vaccination programs. Ontario seems to have higher CAP burden than British Columbia that warrants further investigation. The youngest cohort of children and older adults contribute significantly to the CAP burden. Disclosures Manish Sadarangani, BM BCh, DPhil, GlaxoSmithKline (Grant/Research Support)Merck (Grant/Research Support)Pfizer (Grant/Research Support)Sanofi Pasteur (Grant/Research Support)Seqirus (Grant/Research Support)Symvivo (Grant/Research Support)VBI Vaccines (Research Grant or Support) Allison McGeer, MSc,MD,FRCPC,FSHEA, GlaxoSmithKline (Advisor or Review Panel member)Merck (Advisor or Review Panel member, Research Grant or Support)Pfizer (Grant/Research Support, Scientific Research Study Investigator, Advisor or Review Panel member) James D. Kellner, MD, FRCPC, FIDSA, Pfizer, Merck, GSK, Moderna (Grant/Research Support) Shaun Morris, MD, MPH, DTM&H, FRCPC, FAAP, GSK (Speaker’s Bureau)Pfizer (Advisor or Review Panel member)Pfizer (Grant/Research Support) Shaza A. Fadel, PhD MPH, Merck (Other Financial or Material Support, Salary is paid by the University of Toronto via a donation by Merck to the Centre for Vaccine Preventable Diseases to support educational and operational activities.) Fawziah Marra, BSc(Pharm), PharmD, Pfizer Canada (Research Grant or Support)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,439

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,009
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
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