Mass spectrometric‐based investigation of differentially protected azatryptophan derivatives using Orbitrap mass spectrometry: Differentiation of positional isomers under protonation and alkali‐cationization conditions
Notice bibliographique
Résumé
Rationale Differentiation and structural characterization of positional isomers of differentially protected azatryptophan derivatives using electrospray ionization high‐resolution tandem mass spectrometry (ESI‐HRMS/MS) is important from the perspective of drug discovery research. Also, these derivatives can be used as building blocks for the synthesis of various biologically active compounds and have attracted significant attention in the field of modern drug discovery, especially peptide‐based drugs, protein folding and protein–protein interactions because of their interesting spectral properties. Methods ESI‐HRMS/MS in positive ionization mode was used to differentiate and characterize positional isomers of protected azatryptophan derivatives. Results ESI‐HRMS/MS of [M + H] + and [M + Na] + ions of positional isomers of differentially protected azatryptophan derivatives display distinct fragmentation patterns. The MS/MS of [M + H] + ion of isomer 1 showed an additional ion at m / z 358.0846 ([M + H‐Boc‐C 14 H 10 ‐HF] + ) which was not present for 4 . The fragment ion at m / z 332.0857 was observed for 1 and not for 4 which would be formed by the expulsion of butyloxycarbonyl (Boc) and fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) groups. Moreover, the ions 422.0812 and 378.0912 are found to be relatively more abundant for isomer 4 which could be probably attributed to the formation of stable ions. Similarly, other positional isomers exhibited distinct fragmentation from one another. Conclusions The present study demonstrates that ESI‐HRMS/MS can be used for differentiation and structural characterization of positional isomers of protected azatryptophan derivatives. The MS/MS of [M + H] + and [M + Na] + ions of these positional isomers displayed differences in their fragmentation behaviour. The impact of different substitutions at different positions (1 and 6) of protected azatryptophan derivatives ( 1 – 6 ) on their fragmentation behaviour was also investigated in detail. Also, the nitrogen atom at different positions in the pyrrolopyridine ring led to different fragmentation patterns.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».