Disrupting Biofilm Formation and Antibiotic Resistance in Pseudomonas aeruginosa Using Phage-Delivered Sensitivity Cassettes: A Research Protocol
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Despite antimicrobial resistance topping the list of global health concerns, the development of novel antibiotics has been nearly abandoned due to strict regulations and dwindling economic incentives in the pharmaceutical industry. There is a critical need for alternative strategies to treat multidrug resistant pathogens like Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), a pestilent cause of nosocomial infections. Here, we aim to target adaptive resistance in P. aeruginosa biofilms by inducing hypersensitivity to existing antibiotics through phage-delivery of a particular gene cassette. Previous studies have suggested that the rpoS gene is repressed in P. aeruginosa biofilms and that its deletion is correlated with hypervirulence, increased biofilm thickness and antibiotic resistance. Methods: In this protocol, we aim to explore the effect of inducing rpoS overexpression in P. aeruginosa colonies as a potential method to disrupt biofilm structure and increase sensitivity to tobramycin. Phagemids containing rpoS, an accompanying promoter, and a tellurite resistance gene are delivered by P1 bacteriophages to the biofilm to be shared through horizontal gene transfer (HGT). Tellurite is then administered to induce selective pressure for HGT, by favouring uptake of the phagemids due to the presence of the tellurite resistance gene. Consequently, we can assess the effect of rpoS overexpression on biofilm organization and tobramycin sensitivity using measures from confocal laser scanning microscopy (CLSM). Anticipated Results: Given the hypervirulent effects of rpoS deletion, we expect that forcing rpoS overexpression in P. aeruginosa would result in decreased biofilm thickness compared to controls. Furthermore, the colonies are also expected to have lower cell viability following tobramycin administration. Discussion: Overall, our experiment characterizes the effects of rpoS overexpression on biofilm thickness, cell viability and tobramycin resistance. As such, this protocol may have practical implications for re-sensitization of P.aeroginosa to antibiotics. Conclusion: This would demonstrate a potential for phage-mediated hypersensitization of P. aeruginosa that is adaptable to more practical settings, such as in situ on hospital surfaces.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».