A modified MethyLight assay predicts the clinical outcomes of anti‐epidermal growth factor receptor treatment in metastatic colorectal cancer
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
DNA methylation status correlates with clinical outcomes of anti-epidermal growth factor receptor (EGFR) treatment. There is a strong need to develop a simple assay for measuring DNA methylation status for the clinical application of drug selection based on it. In this study, we collected data from 186 patients with metastatic colorectal cancer (mCRC) who had previously received anti-EGFR treatment. We modified MethyLite to develop a novel assay to classify patients as having highly methylated colorectal cancer (HMCC) or low-methylated colorectal cancer (LMCC) based on the methylation status of 16 CpG sites of tumor-derived genomic DNA in the development cohort (n = 30). Clinical outcomes were then compared between the HMCC and LMCC groups in the validation cohort (n = 156). The results showed that HMCC had a significantly worse response rate (4.2% vs 33.3%; P = .004), progression-free survival (median: 2.5 vs 6.6 mo, P < .001, hazard ratio [HR] = 0.22), and overall survival (median: 5.6 vs 15.5 mo, P < .001, HR = 0.23) than did LMCC in patients with RAS wild-type mCRC who were refractory or intolerable to oxaliplatin- and irinotecan-based chemotherapy (n = 101). The DNA methylation status was an independent predictive factor and a more accurate biomarker than was the primary site of anti-EGFR treatment. In conclusion, our novel DNA methylation measurement assay based on MethyLight was simple and useful, suggesting its implementation as a complementary diagnostic tool in a clinical setting.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle